More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1957 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 
332 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  81.02 
 
 
332 aa  570  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  76.2 
 
 
332 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  75.23 
 
 
333 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  72.48 
 
 
332 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  72.48 
 
 
332 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  73.23 
 
 
329 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  69.58 
 
 
337 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  69.58 
 
 
337 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  64.4 
 
 
332 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  57.98 
 
 
326 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  60.68 
 
 
323 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  57.76 
 
 
321 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  59.44 
 
 
324 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  58.57 
 
 
329 aa  382  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  56.48 
 
 
326 aa  379  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  56.66 
 
 
328 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  57.72 
 
 
324 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  53.73 
 
 
333 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  56.39 
 
 
354 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  57.23 
 
 
320 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  54.32 
 
 
325 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  54.69 
 
 
327 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  56.21 
 
 
329 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  54.66 
 
 
331 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  53.42 
 
 
330 aa  364  1e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  53.27 
 
 
348 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  55.25 
 
 
324 aa  363  3e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  56.04 
 
 
328 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  56 
 
 
337 aa  358  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  54.18 
 
 
328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  55.9 
 
 
329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  54.91 
 
 
327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  55.15 
 
 
327 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  54.83 
 
 
330 aa  355  6.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  54.6 
 
 
327 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  55.93 
 
 
332 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  53.42 
 
 
328 aa  352  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  54.21 
 
 
328 aa  352  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  53.11 
 
 
328 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  53.25 
 
 
331 aa  345  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 
330 aa  345  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 
330 aa  345  7e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 
330 aa  345  7e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  53.25 
 
 
324 aa  345  8e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  53.25 
 
 
333 aa  344  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  51.85 
 
 
330 aa  342  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  51.55 
 
 
334 aa  342  5.999999999999999e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  52.78 
 
 
329 aa  340  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 
330 aa  340  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 
330 aa  340  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 
329 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 
328 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  52.01 
 
 
332 aa  341  1e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 
330 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 
331 aa  340  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 
330 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 
330 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 
330 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 
324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  51.54 
 
 
330 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 
330 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  53.23 
 
 
337 aa  339  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  51.38 
 
 
330 aa  339  5e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  55.66 
 
 
321 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  52.62 
 
 
329 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  52.31 
 
 
327 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  55.66 
 
 
321 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  52.02 
 
 
328 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 
328 aa  334  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 
328 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  53.99 
 
 
328 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 
324 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  49.53 
 
 
328 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  52.48 
 
 
327 aa  331  9e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 
338 aa  330  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  54.06 
 
 
328 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  52.76 
 
 
332 aa  329  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  54.06 
 
 
330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  54.06 
 
 
330 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  52.66 
 
 
330 aa  328  7e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 
330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  54.83 
 
 
331 aa  326  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 
328 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  52.65 
 
 
328 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  52.17 
 
 
328 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 
329 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  54.37 
 
 
322 aa  322  7e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  48.14 
 
 
326 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  51.24 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 
334 aa  317  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  52.53 
 
 
327 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 
328 aa  315  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 
327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  51.58 
 
 
327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  50.14 
 
 
356 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 
328 aa  311  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 
329 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 
329 aa  309  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 
327 aa  309  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>