More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1954 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
468 aa  967    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  54.63 
 
 
641 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.27 
 
 
585 aa  338  9e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  49.57 
 
 
1780 aa  333  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  55.92 
 
 
594 aa  331  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
688 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  55.21 
 
 
971 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  51.38 
 
 
1901 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  46.82 
 
 
1808 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 
537 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  52.58 
 
 
680 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.39 
 
 
699 aa  317  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  51.27 
 
 
458 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  53.55 
 
 
591 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  50.77 
 
 
1850 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 
440 aa  313  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  52.3 
 
 
715 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  53.31 
 
 
1036 aa  312  9e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.76 
 
 
928 aa  310  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  51.3 
 
 
551 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.09 
 
 
439 aa  308  9e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  48.18 
 
 
1811 aa  305  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.09 
 
 
494 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.87 
 
 
675 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 
1123 aa  299  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  51.38 
 
 
468 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
470 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  49.02 
 
 
468 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 
1072 aa  289  9e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  52.7 
 
 
920 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  49.3 
 
 
1795 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  43.06 
 
 
342 aa  272  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 
431 aa  272  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 
407 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 
437 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 
390 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  44.59 
 
 
708 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  43.45 
 
 
730 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  46.69 
 
 
1797 aa  259  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  46.69 
 
 
1804 aa  253  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45.64 
 
 
1794 aa  250  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
440 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 
1942 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  41.82 
 
 
724 aa  243  7.999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 
602 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  46.86 
 
 
1805 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  48.51 
 
 
1934 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
594 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  65.66 
 
 
882 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
589 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
437 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
611 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
611 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  42.31 
 
 
611 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.99 
 
 
2017 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  38.87 
 
 
726 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
679 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
520 aa  230  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  67.53 
 
 
708 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.44 
 
 
695 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
392 aa  226  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 
1021 aa  226  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  59.28 
 
 
663 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  55.96 
 
 
547 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  59.28 
 
 
668 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  59.28 
 
 
668 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  42.11 
 
 
408 aa  222  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  42.11 
 
 
408 aa  222  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
1146 aa  222  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  36.58 
 
 
358 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  37.69 
 
 
626 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  36.78 
 
 
715 aa  219  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  39.33 
 
 
681 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
532 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  38.19 
 
 
305 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 
553 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  40.99 
 
 
406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
1465 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  36.58 
 
 
389 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  36.58 
 
 
389 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  36.58 
 
 
389 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  36.58 
 
 
389 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  36.58 
 
 
358 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  36.58 
 
 
358 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
389 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
470 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  36.42 
 
 
627 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  28.6 
 
 
529 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  36.42 
 
 
627 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  36.42 
 
 
627 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  36.42 
 
 
627 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  35.74 
 
 
627 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  36.42 
 
 
627 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  36.42 
 
 
627 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
678 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  39.78 
 
 
1187 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
467 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  35.31 
 
 
770 aa  206  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4538  histidine kinase  30.82 
 
 
417 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>