More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1948 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  100 
 
 		 349 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  76.77 
 
 		 353 aa  508  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  66.67 
 
 		 341 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  63.47 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  63.47 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  59.28 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  56.41 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  56.7 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  55.37 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  57.91 
 
 		 362 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  53.28 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  51.51 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  56.98 
 
 		 373 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  49.58 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  49.58 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  50.6 
 
 		 349 aa  338  5.9999999999999996e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  50.7 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  47.6 
 
 		 344 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  47.45 
 
 		 342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  47.34 
 
 		 362 aa  308  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  45.93 
 
 		 357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  44.26 
 
 		 362 aa  298  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  41.99 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  60.58 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  38.71 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  40.65 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  49.31 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  39.65 
 
 		 362 aa  222  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  38.08 
 
 		 360 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  36.5 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  36.5 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  37.39 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  36.01 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.55 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  39.47 
 
 		 369 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.91 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  35.01 
 
 		 323 aa  199  9e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  35.45 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  34.9 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.42 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.06 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  34.96 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.88 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.26 
 
 		 349 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  35.71 
 
 		 343 aa  192  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  34.92 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  36.07 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  33.69 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.53 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  31.98 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  31.63 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.15 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.65 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.68 
 
 		 360 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  32.32 
 
 		 367 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  33.05 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  34.72 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  30.27 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  33.63 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.85 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.82 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.03 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  34.42 
 
 		 329 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  33.71 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  30.83 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  31.62 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  42.06 
 
 		 369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  30.3 
 
 		 406 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  30.85 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.63 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  30.39 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  30.17 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  31.57 
 
 		 402 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  31.38 
 
 		 404 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  30.28 
 
 		 423 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  31.96 
 
 		 408 aa  179  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  32.85 
 
 		 328 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  32.85 
 
 		 328 aa  179  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  31.36 
 
 		 406 aa  179  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  31.73 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  33.01 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  30.96 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.43 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  29.67 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  32.97 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  29.56 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.14 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  30.33 
 
 		 402 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  30.36 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 		 422 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  33.14 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  30.23 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.1 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.55 
 
 		 316 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  42.41 
 
 		 460 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  31.78 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  42.41 
 
 		 460 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  32.04 
 
 		 365 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  30.61 
 
 		 394 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  30.38 
 
 		 401 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>