127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1931 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  100 
 
 		 606 aa  1222    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  37.48 
 
 		 542 aa  311  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  38.79 
 
 		 539 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  41.13 
 
 		 531 aa  300  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  36.48 
 
 		 563 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  37.94 
 
 		 550 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  38.36 
 
 		 533 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  37.58 
 
 		 572 aa  290  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  35.83 
 
 		 581 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  38.03 
 
 		 491 aa  289  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  37.87 
 
 		 530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  39.4 
 
 		 574 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  39.6 
 
 		 529 aa  278  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  34.94 
 
 		 624 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  35.64 
 
 		 571 aa  276  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  34.44 
 
 		 639 aa  262  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  37.55 
 
 		 561 aa  262  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  34.95 
 
 		 622 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  35.85 
 
 		 600 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  36.31 
 
 		 604 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  33.21 
 
 		 593 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  34.6 
 
 		 508 aa  246  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  33.71 
 
 		 591 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  33.06 
 
 		 658 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  34.63 
 
 		 643 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  33.73 
 
 		 551 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  33.78 
 
 		 550 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  33.99 
 
 		 543 aa  219  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  32.02 
 
 		 641 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  31.24 
 
 		 586 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  31.24 
 
 		 586 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  33 
 
 		 531 aa  203  9e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  33.6 
 
 		 518 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  32.83 
 
 		 578 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  32.7 
 
 		 548 aa  194  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  31.14 
 
 		 581 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  31.14 
 
 		 581 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  30.57 
 
 		 589 aa  186  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  32.76 
 
 		 645 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  32.75 
 
 		 632 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  32.77 
 
 		 528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  41.37 
 
 		 629 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  29.08 
 
 		 666 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  29.08 
 
 		 666 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  32.4 
 
 		 513 aa  163  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  31.31 
 
 		 524 aa  161  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  31.37 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  30.09 
 
 		 561 aa  157  7e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  33 
 
 		 500 aa  157  7e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  30.78 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  36.42 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  39.37 
 
 		 568 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  31.42 
 
 		 531 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  30.75 
 
 		 514 aa  151  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  41.56 
 
 		 555 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  41.03 
 
 		 543 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  38.43 
 
 		 544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  42 
 
 		 527 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  53.23 
 
 		 188 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  24.3 
 
 		 515 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  24.72 
 
 		 515 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  33.53 
 
 		 450 aa  92  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  44.32 
 
 		 261 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  48.57 
 
 		 262 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  48.57 
 
 		 262 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  66.15 
 
 		 944 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  35.97 
 
 		 485 aa  69.7  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  32.54 
 
 		 440 aa  67  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  26.12 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  37.61 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  28.17 
 
 		 449 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  37.5 
 
 		 673 aa  60.5  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  36.79 
 
 		 932 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.82 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  24.58 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  49.15 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  36.63 
 
 		 946 aa  57.4  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  47.46 
 
 		 400 aa  57  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  37.25 
 
 		 919 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  25 
 
 		 784 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  23.13 
 
 		 437 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  41.43 
 
 		 413 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  22.85 
 
 		 415 aa  54.3  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  30.69 
 
 		 343 aa  53.9  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0779  carbohydrate-selective porin OprB  22.69 
 
 		 467 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000860096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  46.67 
 
 		 1036 aa  53.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  34.85 
 
 		 441 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.36 
 
 		 2551 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  40.26 
 
 		 575 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  35.56 
 
 		 432 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  32.97 
 
 		 255 aa  53.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  27.35 
 
 		 330 aa  52  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  46.3 
 
 		 1821 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  40.62 
 
 		 414 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  31.09 
 
 		 186 aa  51.2  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  50.4  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  32.21 
 
 		 629 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  35.11 
 
 		 424 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  42.25 
 
 		 548 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  22.93 
 
 		 414 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>