19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1903 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1903  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0638518  decreased coverage  0.00545954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3117  hypothetical protein  64.94 
 
 
99 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0045793  normal  0.84646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3002  hypothetical protein  64.94 
 
 
99 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3359  hypothetical protein  55.68 
 
 
100 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5063  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000118221  normal  0.831362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3360  hypothetical protein  48.84 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2076  hypothetical protein  48.39 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.186407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0032  hypothetical protein  45.59 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.199385  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2573  hypothetical protein  45.59 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4165  hypothetical protein  46.15 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4204  hypothetical protein  46.15 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1305  hypothetical protein  44.83 
 
 
194 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4696  hypothetical protein  38.03 
 
 
88 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0776078  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2004  hypothetical protein  38.33 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.50326  normal  0.486112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0218  hypothetical protein  39.71 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.632615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0221  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3006  hypothetical protein  32.88 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.20256  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1696  hypothetical protein  37.1 
 
 
89 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000453326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1570  hypothetical protein  38.1 
 
 
139 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0137027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>