More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1895 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71 
 
 
231 aa  327  7e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  62.5 
 
 
232 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3439  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.7 
 
 
229 aa  275  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
237 aa  167  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
234 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
234 aa  148  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 
234 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
233 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
233 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 
233 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
244 aa  134  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
235 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1682  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.55 
 
 
260 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
240 aa  122  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 
232 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
235 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.97 
 
 
226 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
237 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.21 
 
 
226 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 
241 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
235 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.75 
 
 
231 aa  118  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.37 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
231 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.59 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3079  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.62 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2718  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.41 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.158048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  31.97 
 
 
248 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
236 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2498  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.69 
 
 
260 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3151  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.69 
 
 
260 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  35.59 
 
 
237 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  35.59 
 
 
237 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  35.59 
 
 
237 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.98 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.77 
 
 
255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2793  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.56 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313223  normal  0.208363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.56 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.87 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3286  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.68 
 
 
256 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3073  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.17 
 
 
256 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.789258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 
245 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.5 
 
 
256 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0379215  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
264 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000288198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0669  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.71 
 
 
259 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0399726  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.71 
 
 
258 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.56 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  34.89 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.35 
 
 
259 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4813  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
239 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0943  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.8 
 
 
270 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
225 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2069  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.46 
 
 
256 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
247 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1576  putative D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (BDH) oxidoreductase protein  28.91 
 
 
260 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
261 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  30.2 
 
 
252 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
270 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 
236 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 
237 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.8 
 
 
234 aa  105  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.71 
 
 
257 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  29.58 
 
 
252 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.53 
 
 
256 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.2 
 
 
247 aa  104  9e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.04 
 
 
256 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.12 
 
 
259 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 
256 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.12 
 
 
259 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
248 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  29.71 
 
 
249 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 
251 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
250 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.88 
 
 
252 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.74 
 
 
256 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2468  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  29.15 
 
 
256 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000411328  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  29.37 
 
 
263 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0374  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.37 
 
 
244 aa  103  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.333975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
285 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.86 
 
 
246 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0650  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.43 
 
 
244 aa  102  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.280666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  30.13 
 
 
251 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.31 
 
 
258 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
249 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
254 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12520  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  25.67 
 
 
263 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
246 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>