More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1834 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 
528 aa  1064    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  67.43 
 
 
535 aa  656    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  82.8 
 
 
583 aa  836    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  73.06 
 
 
574 aa  766    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  71.76 
 
 
564 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  71.95 
 
 
564 aa  730    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  58.46 
 
 
553 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  43.36 
 
 
532 aa  345  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  53.24 
 
 
421 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  54.21 
 
 
422 aa  322  7e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  41.96 
 
 
490 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  50.69 
 
 
482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  40.7 
 
 
549 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  48.44 
 
 
442 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  41.01 
 
 
561 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  51.98 
 
 
414 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  40.43 
 
 
540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  47.92 
 
 
425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  39.76 
 
 
582 aa  306  7e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  47.32 
 
 
424 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  47.32 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  47.32 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  47.32 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  47.32 
 
 
354 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  47.32 
 
 
425 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  41.96 
 
 
599 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  41.89 
 
 
546 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  48.21 
 
 
423 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  46.33 
 
 
420 aa  302  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  44.14 
 
 
547 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  46.73 
 
 
425 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  46.72 
 
 
413 aa  299  8e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  46 
 
 
435 aa  299  9e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  53.11 
 
 
395 aa  299  9e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  39.96 
 
 
565 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  38.68 
 
 
569 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  53.42 
 
 
415 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  43.71 
 
 
560 aa  296  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  49.15 
 
 
415 aa  296  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  41.31 
 
 
607 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  44.17 
 
 
503 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  41.31 
 
 
607 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02571  putative GTP-binding protein, transport associated  51.4 
 
 
558 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  42.27 
 
 
563 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  41.12 
 
 
608 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  44.93 
 
 
433 aa  293  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  46.58 
 
 
444 aa  293  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  49.28 
 
 
425 aa  291  3e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  42.41 
 
 
557 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  47.37 
 
 
429 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.89 
 
 
441 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  44.01 
 
 
487 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  41.22 
 
 
409 aa  290  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  47.15 
 
 
434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0382  putative GTP-binding protein, transporter associated  47.22 
 
 
555 aa  289  8e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.506856  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.56 
 
 
493 aa  289  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2311  putative GTP-binding protein, transporter associated  50.84 
 
 
558 aa  288  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.303102 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  42.44 
 
 
458 aa  288  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  42.2 
 
 
557 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  47.32 
 
 
431 aa  286  4e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  44.39 
 
 
493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  42.9 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.74 
 
 
516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  46.96 
 
 
380 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  45.33 
 
 
433 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  47.76 
 
 
435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  43.22 
 
 
580 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  42.62 
 
 
419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  42.62 
 
 
419 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  47.49 
 
 
428 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  46.2 
 
 
429 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  42.62 
 
 
419 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  42.62 
 
 
419 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  42.34 
 
 
419 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  46.13 
 
 
509 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  42.06 
 
 
419 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  41.32 
 
 
401 aa  281  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  46.13 
 
 
434 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  45.01 
 
 
484 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  47.06 
 
 
430 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  47.09 
 
 
420 aa  281  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  43.42 
 
 
522 aa  281  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  46.22 
 
 
479 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  45.92 
 
 
502 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.31 
 
 
454 aa  280  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  42.34 
 
 
419 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  42.34 
 
 
419 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  44.57 
 
 
553 aa  279  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  42.22 
 
 
419 aa  279  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  42.34 
 
 
419 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  45.98 
 
 
493 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  46.02 
 
 
436 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  45.22 
 
 
436 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.74 
 
 
454 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  46.77 
 
 
426 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  46.24 
 
 
403 aa  277  4e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  43.1 
 
 
546 aa  277  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  45.81 
 
 
441 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  46.46 
 
 
426 aa  276  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.06 
 
 
489 aa  276  6e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>