More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1795 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  87.12 
 
 
527 aa  969    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  100 
 
 
529 aa  1093    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  74.9 
 
 
529 aa  803    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  65.09 
 
 
524 aa  695    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  64.89 
 
 
524 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  74.61 
 
 
522 aa  804    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  73.13 
 
 
522 aa  808    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  69.98 
 
 
529 aa  780    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  72.37 
 
 
533 aa  791    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  56.56 
 
 
529 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  55.51 
 
 
523 aa  582  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  54.26 
 
 
525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  54.47 
 
 
533 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  41.93 
 
 
504 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 
600 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  40.45 
 
 
504 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  40 
 
 
503 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 
500 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 
561 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  40.44 
 
 
498 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  39.96 
 
 
504 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  39.8 
 
 
503 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  40.2 
 
 
503 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  38.6 
 
 
502 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  39.92 
 
 
509 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  38.57 
 
 
502 aa  361  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  38.54 
 
 
493 aa  356  5.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  39.48 
 
 
498 aa  356  6.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  37.23 
 
 
520 aa  350  4e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  40.25 
 
 
512 aa  350  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  37.04 
 
 
501 aa  349  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  39.92 
 
 
490 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  38.64 
 
 
546 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
521 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  37.82 
 
 
554 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  38.54 
 
 
534 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  34 
 
 
527 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  35.09 
 
 
539 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  34.67 
 
 
527 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  34.32 
 
 
528 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  33.6 
 
 
527 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  33.86 
 
 
528 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  31.89 
 
 
546 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 
531 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  36.53 
 
 
523 aa  282  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  33.46 
 
 
543 aa  280  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  32.67 
 
 
527 aa  279  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 
547 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  33.07 
 
 
547 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  32.08 
 
 
553 aa  276  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 
547 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  33.07 
 
 
542 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 
547 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  38.13 
 
 
532 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 
527 aa  216  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  29.55 
 
 
430 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 
429 aa  177  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  30 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  30.05 
 
 
428 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  27.39 
 
 
444 aa  160  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 
439 aa  154  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  30.4 
 
 
426 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  28.47 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 
448 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  29.9 
 
 
434 aa  143  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 
459 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  27.58 
 
 
471 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  27.58 
 
 
471 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 
449 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 
451 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 
477 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  26.5 
 
 
490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 
444 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  24.04 
 
 
441 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 
462 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  24.94 
 
 
474 aa  128  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28 
 
 
479 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 
471 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 
472 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 
473 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 
477 aa  118  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  23.63 
 
 
495 aa  117  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 
477 aa  117  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  25.72 
 
 
483 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.42 
 
 
472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.54 
 
 
609 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.59 
 
 
478 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 
475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 
441 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 
434 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  25 
 
 
470 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.94 
 
 
441 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>