16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1742 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1742  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  470  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0262  hypothetical protein  37.74 
 
 
294 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0100  hypothetical protein  35.26 
 
 
184 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0321  hypothetical protein  30.82 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000639905  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1799  hypothetical protein  61.22 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5207  hypothetical protein  56.25 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1517  hypothetical protein  50 
 
 
305 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1544  hypothetical protein  50 
 
 
305 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal  0.0311117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0548  hypothetical protein  53.06 
 
 
277 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10501  hypothetical protein  41.27 
 
 
230 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.126382  hitchhiker  0.00255775 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0368  hypothetical protein  40.98 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3423  hypothetical protein  39.58 
 
 
297 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0548  hypothetical protein  48.84 
 
 
386 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1172  hypothetical protein  46.3 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.2622  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1303  hypothetical protein  38.81 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.2986  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14391  hypothetical protein  36.21 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>