275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1637 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 
391 aa  792    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  74.68 
 
 
391 aa  627  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  58.71 
 
 
392 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  57.42 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  55.91 
 
 
388 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  57.42 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  53.48 
 
 
394 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  50 
 
 
395 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  49.73 
 
 
395 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  47.3 
 
 
434 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  43.92 
 
 
389 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  43.47 
 
 
374 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  41.71 
 
 
403 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  39.52 
 
 
401 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  40.69 
 
 
384 aa  279  6e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  36.64 
 
 
401 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  37.69 
 
 
401 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  37.9 
 
 
400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  36.8 
 
 
386 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  35.12 
 
 
395 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  35.83 
 
 
395 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  34.97 
 
 
386 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  34.48 
 
 
365 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  31.32 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  27.35 
 
 
356 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  27.58 
 
 
391 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  27.06 
 
 
1040 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 
364 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  27.84 
 
 
792 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  27.25 
 
 
361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.81 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  27.08 
 
 
358 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 
364 aa  110  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.68 
 
 
391 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  24.82 
 
 
417 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  25.39 
 
 
444 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 
391 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.37 
 
 
399 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 
387 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 
382 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 
360 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 
423 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.71 
 
 
418 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.13 
 
 
359 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  25.61 
 
 
360 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  27.42 
 
 
359 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  23.64 
 
 
363 aa  100  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  25.45 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 
359 aa  97.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.96 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  23.78 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 
442 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 
1153 aa  90.5  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.72 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  23.54 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 
1061 aa  87  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  26.48 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 
1061 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  21.7 
 
 
360 aa  84  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  21.01 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.54 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.56 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.13 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  24.13 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.27 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  21.89 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.13 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  23.3 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  20.78 
 
 
1096 aa  76.3  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  20.68 
 
 
370 aa  76.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  21.05 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.55 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  26.65 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  33.8 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.93 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.88 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  22.29 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  23.5 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  18.93 
 
 
1111 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  25.76 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  26.01 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  24.55 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  21.16 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  22.16 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  21.54 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  20.85 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>