More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1628 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1026 aa  2110    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
933 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 
1060 aa  337  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1078 aa  301  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
945 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
1043 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  52.87 
 
 
1629 aa  274  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
503 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
937 aa  263  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1369 aa  258  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
1051 aa  253  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  28.91 
 
 
967 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  28.91 
 
 
967 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  29 
 
 
912 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  39.02 
 
 
354 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
790 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 
698 aa  231  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
1207 aa  230  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  37.5 
 
 
872 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0133  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 
766 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
674 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  34.21 
 
 
1119 aa  222  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
1654 aa  217  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
637 aa  209  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
913 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
969 aa  208  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  33.95 
 
 
730 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
965 aa  202  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  29.12 
 
 
608 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
1501 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1002 aa  197  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
639 aa  195  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 
608 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  31.44 
 
 
1133 aa  194  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 
608 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.57 
 
 
944 aa  193  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  28.68 
 
 
938 aa  193  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
1291 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  31.02 
 
 
705 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 
955 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 
1207 aa  191  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
953 aa  190  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
639 aa  190  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
639 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
640 aa  189  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
492 aa  188  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  27.07 
 
 
1763 aa  187  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  34.2 
 
 
762 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 
737 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 
839 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 
1021 aa  185  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
631 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
421 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 
1765 aa  184  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 
935 aa  184  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  31.09 
 
 
1130 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 
1069 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 
1768 aa  184  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
641 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 
869 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
620 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
745 aa  181  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 
557 aa  181  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
1319 aa  181  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  33.53 
 
 
617 aa  180  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
763 aa  180  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
518 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.315276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
1058 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
573 aa  179  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
589 aa  179  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 
919 aa  179  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 
1363 aa  179  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
758 aa  178  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
638 aa  178  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
989 aa  177  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  27.31 
 
 
1765 aa  177  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
640 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
634 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
1767 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
973 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
827 aa  174  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
1767 aa  175  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
754 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 
1784 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 
916 aa  174  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
1767 aa  174  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
969 aa  174  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
1771 aa  173  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
755 aa  173  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
608 aa  172  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 
1786 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 
1792 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
989 aa  171  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  38.49 
 
 
613 aa  171  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
611 aa  171  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 
1782 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  39.75 
 
 
537 aa  170  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
701 aa  170  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
609 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 
689 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>