More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1617 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  100 
 
 		 669 aa  1371    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  65.36 
 
 		 611 aa  834    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  44.81 
 
 		 667 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  40.38 
 
 		 534 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  37.52 
 
 		 589 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  43.35 
 
 		 567 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  39.82 
 
 		 603 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  40.15 
 
 		 663 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  40.15 
 
 		 663 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  37.5 
 
 		 665 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  41.09 
 
 		 575 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  37.5 
 
 		 576 aa  375  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  35.74 
 
 		 662 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  39.48 
 
 		 563 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  36.8 
 
 		 658 aa  364  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  36.43 
 
 		 667 aa  363  6e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  38.14 
 
 		 576 aa  362  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  35.29 
 
 		 668 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  35.56 
 
 		 660 aa  356  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  34.94 
 
 		 660 aa  353  5e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 		 660 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  35 
 
 		 660 aa  350  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  36.44 
 
 		 570 aa  350  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  33.83 
 
 		 662 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  33.6 
 
 		 640 aa  348  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  33.64 
 
 		 662 aa  347  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  34.17 
 
 		 608 aa  334  4e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1675  ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0722052  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  32.73 
 
 		 605 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  31.26 
 
 		 597 aa  266  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  29.92 
 
 		 587 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.92 
 
 		 587 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.59 
 
 		 598 aa  263  6e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  29.26 
 
 		 712 aa  262  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  31.37 
 
 		 606 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  29.12 
 
 		 621 aa  259  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  28.6 
 
 		 589 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  30.4 
 
 		 578 aa  259  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  29.2 
 
 		 575 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  30.06 
 
 		 606 aa  256  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  30 
 
 		 577 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  29.52 
 
 		 589 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  30.47 
 
 		 583 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  29.52 
 
 		 589 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  29.34 
 
 		 589 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  30.94 
 
 		 626 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  28.88 
 
 		 610 aa  253  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  29.68 
 
 		 636 aa  253  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  30.28 
 
 		 615 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 		 588 aa  252  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  29.8 
 
 		 636 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  27.73 
 
 		 589 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  30.24 
 
 		 674 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  27.55 
 
 		 589 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  30.52 
 
 		 602 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  27.48 
 
 		 613 aa  251  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  29.8 
 
 		 634 aa  250  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  29.8 
 
 		 636 aa  250  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 		 588 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  28.23 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  29.12 
 
 		 614 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.71 
 
 		 588 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  28.27 
 
 		 588 aa  249  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 		 584 aa  249  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 		 639 aa  248  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  28.28 
 
 		 596 aa  248  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  28.94 
 
 		 614 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  29.25 
 
 		 592 aa  247  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  29.37 
 
 		 651 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  29.9 
 
 		 595 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  27.75 
 
 		 579 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  28.04 
 
 		 586 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  28.37 
 
 		 660 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  28.04 
 
 		 666 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  27.84 
 
 		 712 aa  239  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  27.8 
 
 		 642 aa  239  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  27.95 
 
 		 593 aa  239  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  28.11 
 
 		 704 aa  238  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  27.84 
 
 		 704 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  29.85 
 
 		 596 aa  237  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  27.54 
 
 		 589 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  28.01 
 
 		 591 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  30 
 
 		 572 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  28.08 
 
 		 614 aa  233  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  28.6 
 
 		 708 aa  232  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  28.51 
 
 		 713 aa  230  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  31.29 
 
 		 637 aa  230  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  27.8 
 
 		 595 aa  229  9e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  28.39 
 
 		 635 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  27.9 
 
 		 630 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 		 577 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  29.71 
 
 		 614 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  26.48 
 
 		 563 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3439  ABC transporter related  30.07 
 
 		 588 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  26.4 
 
 		 583 aa  220  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  27.24 
 
 		 701 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>