42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1517 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  748  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  30.2 
 
 
356 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0574  hypothetical protein  28.57 
 
 
358 aa  111  2e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  29.64 
 
 
336 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  34.81 
 
 
254 aa  81.3  2e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  34.53 
 
 
280 aa  77.4  4e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  35.38 
 
 
237 aa  73.9  4e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  32.12 
 
 
216 aa  69.7  7e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  35 
 
 
241 aa  65.9  1e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0390  hypothetical protein  23.74 
 
 
326 aa  63.9  4e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.525134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4228  hypothetical protein  31.39 
 
 
246 aa  57  5e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  37.96 
 
 
271 aa  54.3  3e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  33.83 
 
 
271 aa  53.5  6e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  33.83 
 
 
271 aa  53.1  7e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  33.83 
 
 
270 aa  53.1  7e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  33.83 
 
 
271 aa  53.1  7e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  26.83 
 
 
298 aa  53.1  8e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  33.83 
 
 
270 aa  52.4  1e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  50.4  5e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  33.08 
 
 
270 aa  50.4  5e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1072  hypothetical protein  30.95 
 
 
264 aa  50.4  5e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.042495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  29.63 
 
 
254 aa  50.1  6e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  29.63 
 
 
254 aa  50.1  6e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0481  Nucleotidyltransferase, predicted  30.15 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  35.04 
 
 
262 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  34.38 
 
 
281 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  30.85 
 
 
255 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3808  hypothetical protein  29.69 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  28.35 
 
 
258 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  36 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  35.63 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  27.47 
 
 
265 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  32.58 
 
 
258 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  32.94 
 
 
251 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  35.63 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  32.32 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  24.52 
 
 
257 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  31 
 
 
260 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  31.63 
 
 
260 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  31 
 
 
260 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  31.63 
 
 
260 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  31.13 
 
 
270 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>