75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1507 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  87.82 
 
 
508 aa  888  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  9.97071e-06  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  79.53 
 
 
519 aa  829  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  78.54 
 
 
519 aa  823  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  84.09 
 
 
508 aa  866  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  71.63 
 
 
507 aa  784  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  71.23 
 
 
507 aa  781  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  73.21 
 
 
510 aa  785  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  70.63 
 
 
507 aa  749  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  85.52 
 
 
508 aa  878  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  1.6119e-07  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  71.83 
 
 
507 aa  784  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  71.63 
 
 
507 aa  783  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  69.71 
 
 
518 aa  738  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  94.3 
 
 
509 aa  968  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  100 
 
 
509 aa  1031  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.24352e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  84.12 
 
 
510 aa  878  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  3.6456e-06  decreased coverage  1.14007e-06 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  70.63 
 
 
507 aa  749  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  87.82 
 
 
508 aa  888  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  88.29 
 
 
508 aa  889  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.42 
 
 
459 aa  94.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  25.4 
 
 
461 aa  92.8  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.25 
 
 
473 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  28.28 
 
 
460 aa  87  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  27.95 
 
 
460 aa  86.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.25 
 
 
460 aa  85.9  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.25 
 
 
460 aa  85.9  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  4.98494e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  25.41 
 
 
460 aa  84  5e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  25.41 
 
 
460 aa  84  6e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  25.41 
 
 
460 aa  84  6e-15  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.55 
 
 
459 aa  83.2  9e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  29.63 
 
 
522 aa  82.4  2e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.55 
 
 
461 aa  81.6  3e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  3.66993e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  24.92 
 
 
460 aa  80.9  5e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  29.07 
 
 
343 aa  79  2e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  24.6 
 
 
459 aa  77  7e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  27.57 
 
 
460 aa  77  8e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  27.19 
 
 
352 aa  73.6  8e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  26.88 
 
 
352 aa  71.2  4e-11  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  27.4 
 
 
352 aa  70.5  6e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  7.22234e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  27.8 
 
 
359 aa  69.3  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  25.83 
 
 
462 aa  68.6  3e-10  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  25.94 
 
 
368 aa  66.2  1e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  27.66 
 
 
345 aa  64.7  3e-09  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  26.02 
 
 
352 aa  64.3  5e-09  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  25.71 
 
 
352 aa  62.8  1e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  23.15 
 
 
464 aa  63.2  1e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  26.19 
 
 
352 aa  62  2e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  25.39 
 
 
352 aa  61.6  3e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  26.21 
 
 
359 aa  61.6  3e-08  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  28.33 
 
 
370 aa  60.5  6e-08  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  27.08 
 
 
352 aa  60.5  7e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  25.87 
 
 
349 aa  59.3  1e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  28 
 
 
370 aa  59.3  2e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  25.87 
 
 
349 aa  59.3  2e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  27.18 
 
 
351 aa  58.2  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  26.62 
 
 
355 aa  57.4  6e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  33.07 
 
 
368 aa  56.6  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  26.22 
 
 
352 aa  55.5  2e-06  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  26.22 
 
 
352 aa  55.5  2e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  25.72 
 
 
344 aa  55.8  2e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  26.42 
 
 
362 aa  55.5  3e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  26.42 
 
 
362 aa  55.5  3e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  25.87 
 
 
352 aa  53.5  8e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  26.89 
 
 
352 aa  53.9  8e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  30.09 
 
 
462 aa  52  2e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  26.04 
 
 
351 aa  52.4  2e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  26.04 
 
 
351 aa  52.4  2e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  25.8 
 
 
354 aa  52  3e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  25.8 
 
 
354 aa  52  3e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  40.3 
 
 
365 aa  51.2  5e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  25.27 
 
 
342 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  25.86 
 
 
342 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  3.46716e-06  hitchhiker  1.17955e-08 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  40 
 
 
350 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  24.29 
 
 
349 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  24.29 
 
 
349 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  37.31 
 
 
361 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0991489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>