More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1505 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  100 
 
 
343 aa  689  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  4.0832e-13  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  90.26 
 
 
341 aa  619  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  87.35 
 
 
321 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  88.82 
 
 
331 aa  561  1e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  88.82 
 
 
331 aa  561  1e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  79.31 
 
 
390 aa  554  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  85.67 
 
 
328 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0694  30S ribosomal protein S1  84.92 
 
 
307 aa  522  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000685189  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  80.07 
 
 
367 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04021  30S ribosomal protein S1  80.07 
 
 
369 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03471  30S ribosomal protein S1  80.14 
 
 
371 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1689  30S ribosomal protein S1  80.07 
 
 
369 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03451  30S ribosomal protein S1  79.02 
 
 
363 aa  458  1e-128  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03371  30S ribosomal protein S1  73.25 
 
 
363 aa  460  1e-128  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0468  30S ribosomal protein S1  80.07 
 
 
386 aa  459  1e-128  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1867  30S ribosomal protein S1  80.14 
 
 
367 aa  459  1e-128  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.61448  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03361  30S ribosomal protein S1  77.27 
 
 
363 aa  453  1e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0318  30S ribosomal protein S1  76.92 
 
 
366 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.721162  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36339  Plastid ribosomal protein S1, imported to chloroplast, small ribosomal subunit  46.51 
 
 
339 aa  292  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10847  predicted protein  48.58 
 
 
284 aa  285  7e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0419  RNA binding S1 domain protein  41.5 
 
 
302 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0430  RNA binding S1 domain protein  41.5 
 
 
302 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.930952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2933  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.14 
 
 
301 aa  232  7e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3732  SSU ribosomal protein S1P  41.22 
 
 
302 aa  229  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  1.10633e-05  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  39.51 
 
 
304 aa  229  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1211  RNA binding S1 domain protein  38.08 
 
 
284 aa  220  2e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3643  RNA binding S1 domain protein  39.37 
 
 
292 aa  213  5e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0726  SSU ribosomal protein S1P  37.79 
 
 
424 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1591  RNA binding S1  37.46 
 
 
295 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.762694 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1637  RNA binding S1  37.72 
 
 
412 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397933  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07751  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  38.3 
 
 
481 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05331  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  36.33 
 
 
416 aa  195  8e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.422935  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  38.99 
 
 
479 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  38.99 
 
 
481 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  38.99 
 
 
479 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  38.99 
 
 
479 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  39.93 
 
 
495 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  38.99 
 
 
481 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  38.99 
 
 
481 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  38.03 
 
 
491 aa  192  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  40.07 
 
 
495 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  38.08 
 
 
487 aa  190  3e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  38.97 
 
 
485 aa  190  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  39.71 
 
 
500 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  35.85 
 
 
465 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1861  SSU ribosomal protein S1P  35.85 
 
 
431 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0931144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  39.35 
 
 
487 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  39.35 
 
 
480 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  39.25 
 
 
490 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  39.25 
 
 
485 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  9.5518e-05  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  39.18 
 
 
491 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  39.18 
 
 
491 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.61597e-14 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  38.63 
 
 
488 aa  186  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  38.63 
 
 
496 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  38.63 
 
 
485 aa  186  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  39.18 
 
 
496 aa  185  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  37.94 
 
 
499 aa  185  1e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  38.24 
 
 
492 aa  185  1e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  38.04 
 
 
488 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  37.46 
 
 
515 aa  183  4e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  38.81 
 
 
490 aa  182  5e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  37.91 
 
 
492 aa  182  5e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  38.63 
 
 
492 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  38.95 
 
 
500 aa  182  6e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  38.63 
 
 
493 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.86 
 
 
393 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  3.10337e-05  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  38.81 
 
 
488 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.81 
 
 
388 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  39.35 
 
 
493 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  37.7 
 
 
427 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05941  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  33.45 
 
 
408 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  36.79 
 
 
493 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  39.35 
 
 
493 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  33.22 
 
 
401 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.974619  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05561  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  33.56 
 
 
401 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.748166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  38.06 
 
 
493 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  39.78 
 
 
405 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  38.06 
 
 
418 aa  176  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  36.07 
 
 
397 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  1.9918e-05  unclonable  5.35173e-08 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.05 
 
 
397 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  38.06 
 
 
505 aa  174  3e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0530  SSU ribosomal protein S1P  32.2 
 
 
404 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  39.08 
 
 
403 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  38.58 
 
 
507 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  34.66 
 
 
686 aa  170  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  32.88 
 
 
529 aa  163  4e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  38.46 
 
 
705 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  37.98 
 
 
736 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.29 
 
 
403 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  34.83 
 
 
400 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.58 
 
 
411 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  36.11 
 
 
678 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  8.87819e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  34.75 
 
 
654 aa  153  3e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  35.69 
 
 
677 aa  154  3e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2024  SSU ribosomal protein S1P  36.8 
 
 
411 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  32.13 
 
 
599 aa  152  9e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  31.89 
 
 
619 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  35.34 
 
 
382 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.30459e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  36.22 
 
 
382 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  36.22 
 
 
382 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.40216e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>