More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1466 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  60.88 
 
 
619 aa  717  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0861  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  65.48 
 
 
631 aa  802  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  1.95536e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1466  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
627 aa  1244  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.00817e-10  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  60.13 
 
 
627 aa  736  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  1.55726e-05  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0604  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.04 
 
 
612 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594044  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0589  cell wall hydrolase/autolysin  44.04 
 
 
612 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1798  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.13 
 
 
623 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.12 
 
 
706 aa  400  1e-110  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.85 
 
 
619 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.32 
 
 
338 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  5.34753e-06  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.48 
 
 
338 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3123  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.48 
 
 
332 aa  199  2e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.91 
 
 
344 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.78 
 
 
287 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0435442  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2134  cell wall hydrolase/autolysin  48.59 
 
 
349 aa  182  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.373316  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18931  cell wall hydrolase/autolysin  51.91 
 
 
396 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10331  cell wall hydrolase/autolysin  47.83 
 
 
362 aa  175  3e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  normal  0.548996 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06811  cell wall hydrolase/autolysin  41.23 
 
 
364 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.197381  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.35 
 
 
364 aa  162  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.779123  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06721  cell wall hydrolase/autolysin  45.95 
 
 
361 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.347132  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0616  cell wall hydrolase/autolysin  45.41 
 
 
361 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06421  cell wall hydrolase/autolysin  45.95 
 
 
361 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06741  cell wall hydrolase/autolysin  49.18 
 
 
354 aa  154  3e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142598  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0053  cell wall hydrolase/autolysin  48.91 
 
 
361 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1135  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.31 
 
 
364 aa  148  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0223149  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2385  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.94 
 
 
458 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.282435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.13 
 
 
471 aa  135  2e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1752  cell wall hydrolase/autolysin  34.08 
 
 
419 aa  132  2e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.0425e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.11 
 
 
657 aa  131  4e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.08 
 
 
190 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.72144e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.44 
 
 
476 aa  129  1e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.33632e-08  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.34 
 
 
431 aa  129  2e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.15725e-07 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1425  cell wall hydrolase/autolysin  36.05 
 
 
423 aa  129  2e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0357452  normal  0.827942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  45.28 
 
 
424 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  2.66476e-06 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2496  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.02 
 
 
413 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  53.15 
 
 
442 aa  127  4e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1037  cell wall hydrolase/autolysin  37.5 
 
 
282 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  5.20561e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1578  cell wall hydrolase/autolysin  37.04 
 
 
240 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.78 
 
 
543 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.90327e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.95 
 
 
746 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.97 
 
 
751 aa  122  1e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2027  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.39 
 
 
279 aa  122  2e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  37.36 
 
 
451 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.53724e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.04 
 
 
448 aa  121  4e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1821  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.02 
 
 
419 aa  120  8e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00645936  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  36.84 
 
 
268 aa  120  8e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000536287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2161  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.02 
 
 
603 aa  119  1e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.72441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2251  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.02 
 
 
603 aa  119  1e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0506573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1694  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.02 
 
 
608 aa  119  2e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.739566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.32 
 
 
907 aa  119  2e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1062  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.09 
 
 
432 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5657  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.47 
 
 
390 aa  117  4e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0776  cell wall hydrolase/autolysin  40 
 
 
236 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0332  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 
263 aa  115  2e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000783569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1162  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.39 
 
 
233 aa  115  2e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.820741  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0802  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase family protein  30.22 
 
 
412 aa  115  2e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.535912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  34.31 
 
 
535 aa  115  2e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.94264e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  34.31 
 
 
535 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.69647e-08  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3199  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.32 
 
 
471 aa  114  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.384074  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  34.02 
 
 
407 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1153  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.94 
 
 
731 aa  114  7e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.14 
 
 
448 aa  114  8e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2626  hypothetical protein  32.92 
 
 
476 aa  113  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  34.55 
 
 
527 aa  113  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.86208e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  34.33 
 
 
530 aa  112  1e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  3.64595e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2572  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  31.02 
 
 
289 aa  113  1e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2409  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.83 
 
 
507 aa  113  1e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262199  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2941  cell wall hydrolase/autolysin  37.5 
 
 
250 aa  113  1e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.01461e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4358  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.78 
 
 
419 aa  112  1e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2753  hypothetical protein  32.92 
 
 
476 aa  113  1e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.57 
 
 
474 aa  112  2e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1410  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 
366 aa  112  2e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2644  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  31.37 
 
 
289 aa  112  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2807  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  31.14 
 
 
289 aa  112  2e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2686  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  31.37 
 
 
289 aa  112  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148048  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2595  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  31.37 
 
 
289 aa  112  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2816  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  31.37 
 
 
289 aa  112  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474935  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2721  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  31.14 
 
 
289 aa  112  2e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3665  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  31.14 
 
 
289 aa  112  2e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.353577  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2710  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  31.37 
 
 
289 aa  112  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.29 
 
 
377 aa  112  2e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AMIC precursor protein  33.33 
 
 
507 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0045  surface-layer n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase  35.08 
 
 
531 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.5922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  35.79 
 
 
538 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0650  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.13 
 
 
525 aa  111  4e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0526  cell wall hydrolase/autolysin  34.89 
 
 
497 aa  111  4e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  34.72 
 
 
413 aa  111  4e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.59428e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1144  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.48 
 
 
427 aa  111  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.54103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0885  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.07 
 
 
300 aa  111  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0020686  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1209  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.69 
 
 
469 aa  110  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2815  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.47 
 
 
506 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2956  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  29.67 
 
 
291 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.702155  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2590  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  30.82 
 
 
289 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0859  cell wall hydrolase/autolysin  38.07 
 
 
231 aa  110  7e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.751216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3748  cell wall hydrolase/autolysin  35.26 
 
 
237 aa  110  8e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1244  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  30.63 
 
 
289 aa  110  8e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02297  hypothetical protein  30.63 
 
 
289 aa  110  8e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1226  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.63 
 
 
289 aa  110  8e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02335  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  30.63 
 
 
289 aa  110  8e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1511  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.23 
 
 
577 aa  110  8e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00018605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>