More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1462 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
120 aa  244  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  2.99636e-14  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  81.67 
 
 
120 aa  205  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  69.64 
 
 
119 aa  172  2e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  65.81 
 
 
122 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  65.81 
 
 
122 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  71.96 
 
 
121 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  68.75 
 
 
123 aa  161  2e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  60 
 
 
125 aa  150  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  64.49 
 
 
129 aa  149  9e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  64.49 
 
 
129 aa  149  9e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  61.82 
 
 
128 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  59.13 
 
 
125 aa  148  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  55.46 
 
 
120 aa  145  2e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  53.85 
 
 
127 aa  140  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  56.07 
 
 
123 aa  137  5e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  56.07 
 
 
124 aa  137  5e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  55.14 
 
 
133 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  53.21 
 
 
123 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  49.06 
 
 
135 aa  110  7e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  46.73 
 
 
127 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  39.25 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  38.14 
 
 
120 aa  84.3  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  34.78 
 
 
115 aa  83.6  1e-15  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.19 
 
 
206 aa  80.5  7e-15  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  36.67 
 
 
134 aa  80.1  9e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.3456e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  35.85 
 
 
164 aa  79  2e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  3.51539e-07  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  38.68 
 
 
149 aa  79.3  2e-14  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  37.14 
 
 
224 aa  79  2e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.58869e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  34.91 
 
 
170 aa  79  2e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  35.66 
 
 
175 aa  79  2e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  33.33 
 
 
171 aa  78.6  3e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  32.23 
 
 
172 aa  78.2  3e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  36.61 
 
 
166 aa  78.2  3e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  35.9 
 
 
214 aa  78.2  3e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  35.65 
 
 
167 aa  78.2  4e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  33.88 
 
 
138 aa  78.2  4e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  35.04 
 
 
157 aa  78.2  4e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  40.18 
 
 
147 aa  77.8  5e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  40.52 
 
 
176 aa  77.4  6e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  36.04 
 
 
161 aa  77.4  6e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  5.49741e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  37.38 
 
 
173 aa  77  8e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  35.45 
 
 
188 aa  76.3  1e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  35.24 
 
 
200 aa  76.3  1e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  30.56 
 
 
220 aa  76.3  1e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.86084e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  34.17 
 
 
161 aa  76.3  1e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  36.94 
 
 
187 aa  75.9  2e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  35.51 
 
 
183 aa  75.5  2e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  35.24 
 
 
196 aa  75.1  3e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  32.48 
 
 
157 aa  74.7  4e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  32.79 
 
 
164 aa  74.3  5e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  35.45 
 
 
184 aa  73.9  6e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  38.52 
 
 
172 aa  73.9  6e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  6.12973e-07  hitchhiker  1.72856e-11 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  32.43 
 
 
190 aa  73.9  7e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 
182 aa  73.9  7e-13  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 
183 aa  73.6  8e-13  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 
182 aa  73.6  8e-13  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 
176 aa  72.8  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 
176 aa  72.8  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 
176 aa  72.8  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  36.19 
 
 
191 aa  73.6  1e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  33.64 
 
 
169 aa  72.8  1e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  35.77 
 
 
139 aa  73.2  1e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 
176 aa  72.8  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 
176 aa  72.8  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  28.7 
 
 
231 aa  72.4  2e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  9.41126e-08  unclonable  1.10243e-10 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  31.97 
 
 
164 aa  72.4  2e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  35.78 
 
 
159 aa  72  2e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  30.89 
 
 
143 aa  72.4  2e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  29.63 
 
 
225 aa  72.8  2e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.64603e-08  unclonable  1.89971e-08 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  34.23 
 
 
162 aa  72  3e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  33.06 
 
 
183 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  33.02 
 
 
149 aa  71.6  3e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.43406e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  36.79 
 
 
184 aa  72  3e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  32.5 
 
 
188 aa  71.6  3e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  35.78 
 
 
159 aa  72  3e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  37.62 
 
 
180 aa  71.6  4e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  39.25 
 
 
175 aa  71.2  4e-12  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  31.71 
 
 
236 aa  71.2  4e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  39.25 
 
 
133 aa  71.2  4e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  9.00407e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  34.48 
 
 
174 aa  71.2  4e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  31.71 
 
 
238 aa  71.6  4e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  34.96 
 
 
139 aa  70.9  5e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  35.71 
 
 
168 aa  71.2  5e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  3.5276e-07 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  28.57 
 
 
242 aa  71.2  5e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  5.68362e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  29.2 
 
 
148 aa  70.9  5e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  35.71 
 
 
181 aa  70.9  5e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  31.03 
 
 
231 aa  71.2  5e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  33.04 
 
 
157 aa  70.9  6e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2049  single-strand binding protein  32.14 
 
 
138 aa  70.9  6e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  31.71 
 
 
234 aa  70.9  6e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  31.71 
 
 
234 aa  70.9  6e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  29.75 
 
 
143 aa  70.9  6e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  8.57397e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  31.71 
 
 
236 aa  70.9  6e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  37.17 
 
 
183 aa  70.9  6e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  31.71 
 
 
234 aa  70.9  6e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.1541e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  28.89 
 
 
146 aa  70.5  7e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.56614e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  33.64 
 
 
167 aa  70.5  7e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  32.79 
 
 
152 aa  70.5  7e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  36.28 
 
 
165 aa  70.5  7e-12  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  37.62 
 
 
181 aa  70.5  7e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>