15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1459 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1459  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000164986  hitchhiker  0.0000261489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0868  rod shape-determining protein MreD  64.93 
 
 
211 aa  266  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000649677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1732  rod shape-determining protein MreD  60.11 
 
 
183 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.158456  normal  0.172881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4128  rod shape-determining protein MreD  67.31 
 
 
181 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4168  rod shape-determining protein MreD  67.31 
 
 
181 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0147554  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3389  rod shape-determining protein MreD  52.81 
 
 
179 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0375737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1152  hypothetical protein  56.25 
 
 
198 aa  178  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.450592  hitchhiker  0.00560456 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0298  hypothetical protein  31.31 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17461  hypothetical protein  27.21 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  29.61 
 
 
166 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0151  hypothetical protein  24.84 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  35.29 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20721  hypothetical protein  26.17 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  29.17 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1197  hypothetical protein  25.5 
 
 
166 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>