More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1425 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4965  UvrD/REP helicase  54.23 
 
 		 781 aa  850    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3290  UvrD/REP helicase  54.92 
 
 		 783 aa  848    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.353661  normal  0.284244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1425  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 833 aa  1707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4621  UvrD/REP helicase  56.92 
 
 		 776 aa  851    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2533  UvrD/REP helicase  54.02 
 
 		 808 aa  877    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313169  normal  0.108107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2810  UvrD/REP helicase  54.92 
 
 		 783 aa  848    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4314  UvrD/REP helicase  71.01 
 
 		 785 aa  1159    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2515  putative DNA helicase  46.65 
 
 		 755 aa  389  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3948  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 		 748 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0206  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 		 743 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 1134 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.48 
 
 		 781 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.36 
 
 		 781 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.07 
 
 		 677 aa  70.5  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  25.99 
 
 		 679 aa  70.5  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 677 aa  70.5  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  25.74 
 
 		 1103 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 664 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1226  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  24.21 
 
 		 664 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  25 
 
 		 671 aa  68.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.35 
 
 		 772 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.52 
 
 		 682 aa  68.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.4 
 
 		 662 aa  68.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  27.4 
 
 		 662 aa  68.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.66 
 
 		 772 aa  67.4  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  23.02 
 
 		 807 aa  67.4  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  25 
 
 		 671 aa  66.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  25.62 
 
 		 685 aa  66.6  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.15 
 
 		 671 aa  64.7  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  28.28 
 
 		 717 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  29.21 
 
 		 726 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  25.54 
 
 		 665 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.64 
 
 		 674 aa  63.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.64 
 
 		 670 aa  63.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.2 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06510  ATP-dependent DNA helicase pcra, putative  23.66 
 
 		 982 aa  62.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3542  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  59.18 
 
 		 464 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.68 
 
 		 776 aa  62  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  24.56 
 
 		 671 aa  62  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  27.61 
 
 		 1059 aa  61.6  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 		 1135 aa  61.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  24.37 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  25.66 
 
 		 658 aa  61.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  65.38 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  24.82 
 
 		 678 aa  60.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4147  ATP-dependent DNA helicase Rep  24 
 
 		 670 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0515139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  22.58 
 
 		 728 aa  60.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.66 
 
 		 715 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.74 
 
 		 667 aa  59.7  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  24.37 
 
 		 1060 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3746  UvrD/REP helicase  28.08 
 
 		 730 aa  59.7  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  28.29 
 
 		 1062 aa  60.1  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  22.58 
 
 		 737 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  25.8 
 
 		 705 aa  60.1  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  26.52 
 
 		 1060 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0795  UvrD/REP helicase  23.19 
 
 		 639 aa  59.3  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.790736  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.86 
 
 		 814 aa  59.3  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  22.22 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.28 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.38 
 
 		 707 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.07 
 
 		 892 aa  58.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.82 
 
 		 797 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0199  ATP-dependent DNA helicase Rep  24 
 
 		 674 aa  57.8  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  22.99 
 
 		 845 aa  57.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  22.66 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.71 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.66 
 
 		 817 aa  57.8  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 1106 aa  57  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.47 
 
 		 706 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.29 
 
 		 765 aa  57.4  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.45 
 
 		 673 aa  57  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_51012  protein required for proper timing of committment to meiotic recombination and the transition from Meiosis I to Meiosis II  32.2 
 
 		 908 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.875639  normal  0.91244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.38 
 
 		 730 aa  57.4  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.47 
 
 		 669 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.28 
 
 		 673 aa  57.4  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  26.41 
 
 		 817 aa  57  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.37 
 
 		 669 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.47 
 
 		 665 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.36 
 
 		 674 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.36 
 
 		 674 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  22.58 
 
 		 783 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.28 
 
 		 669 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0360  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.64 
 
 		 671 aa  56.6  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.69251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.36 
 
 		 674 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.36 
 
 		 674 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  24.1 
 
 		 641 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0754  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.18 
 
 		 587 aa  55.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.643559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2919  UvrD/REP helicase  22.26 
 
 		 621 aa  55.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.27 
 
 		 1094 aa  55.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.64 
 
 		 675 aa  56.2  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  23.38 
 
 		 678 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  23.1 
 
 		 671 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.83 
 
 		 682 aa  55.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.66 
 
 		 685 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  23.1 
 
 		 671 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  24.45 
 
 		 515 aa  55.1  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1624  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.98 
 
 		 1240 aa  55.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.547512  normal  0.545211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  20.64 
 
 		 666 aa  55.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.27 
 
 		 674 aa  55.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.74 
 
 		 671 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>