More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1386 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
734 aa  1479    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  39.89 
 
 
742 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  41.62 
 
 
736 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  40.53 
 
 
722 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  36.94 
 
 
741 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.86 
 
 
720 aa  270  8e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  28.61 
 
 
727 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  26.74 
 
 
753 aa  237  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  26.41 
 
 
750 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 
804 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.77 
 
 
743 aa  228  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.52 
 
 
790 aa  219  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.87 
 
 
756 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  27.24 
 
 
745 aa  217  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  25.17 
 
 
739 aa  216  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.24 
 
 
779 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  25.48 
 
 
763 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  27.03 
 
 
755 aa  206  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  24.87 
 
 
803 aa  204  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.42 
 
 
753 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
730 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  24.97 
 
 
743 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  24.15 
 
 
684 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  26.2 
 
 
741 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25 
 
 
721 aa  195  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.41 
 
 
772 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.35 
 
 
739 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  44.34 
 
 
246 aa  184  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  26.24 
 
 
756 aa  183  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  26.4 
 
 
801 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  33.44 
 
 
464 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  27.43 
 
 
713 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 
738 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  23.82 
 
 
803 aa  174  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  27.12 
 
 
806 aa  173  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.65 
 
 
726 aa  173  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.07 
 
 
734 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 
731 aa  170  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.95 
 
 
496 aa  170  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
778 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.22 
 
 
575 aa  168  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.7 
 
 
711 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.58 
 
 
217 aa  167  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  41.58 
 
 
217 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  40.1 
 
 
233 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.12 
 
 
739 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  39.8 
 
 
232 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  38.6 
 
 
472 aa  164  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  27.41 
 
 
527 aa  164  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
737 aa  164  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  25.41 
 
 
723 aa  163  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.44 
 
 
736 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  39.6 
 
 
233 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  24.93 
 
 
741 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.39 
 
 
235 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  43.15 
 
 
242 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  26.02 
 
 
723 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  39.11 
 
 
233 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  28.67 
 
 
802 aa  162  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.39 
 
 
454 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  26 
 
 
774 aa  162  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.79 
 
 
727 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  38.61 
 
 
233 aa  161  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  24.67 
 
 
749 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  39.11 
 
 
233 aa  161  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  25.95 
 
 
802 aa  161  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  25.46 
 
 
797 aa  160  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.61 
 
 
234 aa  160  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  33.66 
 
 
505 aa  160  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  34.89 
 
 
466 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  26.61 
 
 
746 aa  160  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  23.84 
 
 
756 aa  160  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  33.23 
 
 
624 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  23.58 
 
 
710 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.46 
 
 
726 aa  158  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.46 
 
 
726 aa  158  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  27.46 
 
 
726 aa  158  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  41.12 
 
 
233 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.46 
 
 
726 aa  159  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.46 
 
 
726 aa  158  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.46 
 
 
726 aa  158  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  27.46 
 
 
726 aa  158  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.46 
 
 
726 aa  158  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  31.02 
 
 
734 aa  158  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  24.09 
 
 
739 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  23 
 
 
790 aa  157  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.78 
 
 
741 aa  157  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  26.99 
 
 
739 aa  157  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  24.71 
 
 
751 aa  157  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.05 
 
 
492 aa  157  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  26.99 
 
 
739 aa  157  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.75 
 
 
240 aa  157  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  41.59 
 
 
224 aa  157  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  24.58 
 
 
733 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  29.74 
 
 
734 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.17 
 
 
737 aa  156  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  25.51 
 
 
744 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  29.75 
 
 
509 aa  156  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.34 
 
 
726 aa  156  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  33.12 
 
 
508 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>