182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1346 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  225  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  48.89 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4743  hypothetical protein  44.44 
 
 
83 aa  88.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  49.46 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  49.46 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2241  hypothetical protein  44.21 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.78 
 
 
410 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  43.66 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
614 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  30.48 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  38.46 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.95 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  34.62 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  34.69 
 
 
112 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  32.43 
 
 
123 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  34.69 
 
 
112 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.18 
 
 
410 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.67 
 
 
408 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  34.33 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  34.33 
 
 
102 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  32.98 
 
 
635 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  33.67 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  39.24 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 
596 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
614 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  41.51 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.71 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  26.13 
 
 
343 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  29.03 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  36 
 
 
626 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  33.33 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 
607 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
572 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  29.89 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 
607 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  30.21 
 
 
222 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  32.88 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 
595 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
597 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  31.25 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  33.33 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  30.21 
 
 
626 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  40.82 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  29.47 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  29.47 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  33.66 
 
 
182 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  30.21 
 
 
626 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  35.19 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  28.74 
 
 
562 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  31.71 
 
 
105 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  33.66 
 
 
182 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  31.71 
 
 
105 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  33.78 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  35.19 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  30 
 
 
217 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  33.78 
 
 
532 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  30.39 
 
 
603 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  28.77 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  31.34 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  26.76 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  31.34 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
598 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0844  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.65 
 
 
291 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.923972  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1599  hypothetical protein  42.11 
 
 
246 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  27.96 
 
 
677 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  27.4 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
597 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  34.25 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  34.48 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  25.71 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  36.36 
 
 
130 aa  52  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  32.14 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  31.34 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  31.34 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  35.85 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
596 aa  52  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  31.52 
 
 
610 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.19 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0160  hypothetical protein  31.4 
 
 
290 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  28.75 
 
 
101 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  35.71 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  34.18 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  37.04 
 
 
219 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  23.68 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
602 aa  51.2  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  32.43 
 
 
119 aa  50.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  29.11 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  37.5 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  30.36 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  26.53 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  31.51 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1111  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  29.85 
 
 
101 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  32.69 
 
 
103 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  31.11 
 
 
569 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.07 
 
 
597 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  32.58 
 
 
604 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  35.44 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  36 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  30.59 
 
 
594 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>