More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1321 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  100 
 
 
71 aa  141  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  7.49157e-08  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  94.37 
 
 
71 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  83.1 
 
 
71 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  80 
 
 
73 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  80 
 
 
73 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  80.28 
 
 
71 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  75.71 
 
 
73 aa  119  1e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  77.46 
 
 
71 aa  118  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  77.14 
 
 
73 aa  119  2e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  77.14 
 
 
73 aa  119  2e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  77.14 
 
 
73 aa  119  2e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  77.14 
 
 
73 aa  119  2e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  77.46 
 
 
71 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  77.46 
 
 
71 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  75.71 
 
 
72 aa  117  5e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  74.29 
 
 
73 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  74.29 
 
 
73 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  72.86 
 
 
73 aa  116  1e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  1.61977e-07 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  72.22 
 
 
78 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  71.7 
 
 
78 aa  84  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.83869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  72.22 
 
 
78 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  72.55 
 
 
77 aa  83.2  1e-15  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  6.9363e-08  hitchhiker  1.01757e-10 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
77 aa  81.3  4e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.87708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
77 aa  81.3  4e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
77 aa  81.3  4e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
77 aa  81.3  4e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
77 aa  81.3  4e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
77 aa  81.3  4e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.35632e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
77 aa  81.3  4e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  69.64 
 
 
80 aa  80.9  5e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  3.57277e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
77 aa  81.3  5e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
77 aa  81.3  5e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
77 aa  81.3  5e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.78788e-06  hitchhiker  1.90479e-07 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  69.64 
 
 
80 aa  80.9  5e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.44955e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  58.57 
 
 
89 aa  81.3  5e-15  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  1.41185e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
77 aa  81.3  5e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  59.38 
 
 
75 aa  80.5  7e-15  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  2.13822e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 
79 aa  80.5  8e-15  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 
79 aa  80.5  8e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  2.56542e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  68.52 
 
 
80 aa  79.7  1e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  5.28471e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  56.92 
 
 
96 aa  79.7  1e-14  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  68.52 
 
 
80 aa  79.7  1e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  6.75119e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 
76 aa  79.3  1e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.0625e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  67.31 
 
 
81 aa  79.3  2e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  64.81 
 
 
76 aa  79  2e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.46821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 
94 aa  79  2e-14  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 
80 aa  78.6  3e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 
81 aa  78.6  3e-14  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 
92 aa  78.2  3e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.37782e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  71.15 
 
 
88 aa  77.8  5e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.79009e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
91 aa  77.4  6e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
94 aa  77.4  6e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  5.47556e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3119  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
88 aa  77.4  7e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.258718  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  64.15 
 
 
65 aa  76.3  1e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
95 aa  76.6  1e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  66 
 
 
97 aa  75.5  2e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  60 
 
 
91 aa  75.9  2e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.65464e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  65.38 
 
 
75 aa  75.1  3e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  62.96 
 
 
74 aa  75.1  3e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.9732e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  64 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.52962e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  71.43 
 
 
81 aa  74.7  4e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 
92 aa  74.7  4e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 
77 aa  74.3  5e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  61.11 
 
 
76 aa  74.3  5e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  60.78 
 
 
106 aa  73.9  6e-13  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 
74 aa  73.9  7e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  71.43 
 
 
76 aa  73.6  8e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 
75 aa  73.6  8e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 
90 aa  73.6  9e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  62.75 
 
 
81 aa  73.2  1e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  72 
 
 
75 aa  73.2  1e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1415  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 
74 aa  72.8  1e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 
76 aa  73.2  1e-12  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.03271e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  66 
 
 
74 aa  72.8  1e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  7.42104e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 
90 aa  73.2  1e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 
75 aa  73.2  1e-12  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  60.38 
 
 
78 aa  72  2e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4309  30S ribosomal protein S18  62.75 
 
 
84 aa  72.4  2e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0685461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3745  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 
75 aa  72.4  2e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00458678  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4416  30S ribosomal protein S18  62.75 
 
 
84 aa  72.4  2e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  64 
 
 
105 aa  72.4  2e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3941  30S ribosomal protein S18  62.75 
 
 
84 aa  72.4  2e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.182221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  53.73 
 
 
106 aa  72.8  2e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 
75 aa  72  3e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 
75 aa  72  3e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  65.38 
 
 
76 aa  72  3e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 
75 aa  72  3e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 
82 aa  71.6  3e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  58.82 
 
 
84 aa  72  3e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  3.14469e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0889  SSU ribosomal protein S18P  57.41 
 
 
75 aa  71.2  4e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 
75 aa  71.2  4e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39410  SSU ribosomal protein S18P  53.7 
 
 
82 aa  71.6  4e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  62.75 
 
 
70 aa  71.2  5e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.6386e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 
75 aa  71.2  5e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 
91 aa  70.9  5e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5420  30S ribosomal protein S18  60.78 
 
 
83 aa  71.2  5e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0173473  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03777  30S ribosomal protein S18  57.41 
 
 
75 aa  71.2  5e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  59.26 
 
 
75 aa  71.2  5e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2295  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 
79 aa  71.2  5e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0262135  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0413  30S ribosomal protein S18  60 
 
 
78 aa  71.2  5e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>