187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1150 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  64.35 
 
 		 561 aa  720    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  67.46 
 
 		 558 aa  748    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 560 aa  1158    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  67.28 
 
 		 558 aa  746    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  55.3 
 
 		 581 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  52.02 
 
 		 555 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  52.05 
 
 		 567 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  47.6 
 
 		 663 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  43.71 
 
 		 614 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  43.71 
 
 		 614 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  43.71 
 
 		 614 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  38.05 
 
 		 677 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2225  integrase catalytic subunit  61.97 
 
 		 251 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5797  integrase catalytic subunit  48.95 
 
 		 245 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  29.56 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  29.56 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  29.7 
 
 		 497 aa  173  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  29.7 
 
 		 497 aa  173  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  29.7 
 
 		 497 aa  173  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  27.99 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  27.84 
 
 		 481 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  28.6 
 
 		 618 aa  161  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  34.88 
 
 		 552 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 468 aa  154  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  26.62 
 
 		 625 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2185  transposase  37.79 
 
 		 224 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  30.99 
 
 		 556 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  30.99 
 
 		 556 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  30.99 
 
 		 556 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  30.99 
 
 		 556 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  26.44 
 
 		 616 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  29.72 
 
 		 547 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  26.15 
 
 		 614 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 630 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  30.33 
 
 		 541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  30.33 
 
 		 541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  30.33 
 
 		 541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  30.33 
 
 		 541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  27.07 
 
 		 618 aa  131  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  27.07 
 
 		 618 aa  131  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  27.65 
 
 		 595 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  31.52 
 
 		 617 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  31.16 
 
 		 617 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  29.19 
 
 		 536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  25.17 
 
 		 640 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  32.26 
 
 		 554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  25.66 
 
 		 636 aa  128  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  25.81 
 
 		 640 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  28.35 
 
 		 560 aa  127  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  31.97 
 
 		 572 aa  127  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  31.97 
 
 		 562 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  25.9 
 
 		 626 aa  126  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  31.97 
 
 		 509 aa  126  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  25.52 
 
 		 632 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  27.94 
 
 		 550 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  26.88 
 
 		 551 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  28.98 
 
 		 810 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  33.06 
 
 		 649 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  27.68 
 
 		 652 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 		 652 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  27.68 
 
 		 652 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  27.68 
 
 		 677 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  26.26 
 
 		 653 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  26.51 
 
 		 611 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  28.44 
 
 		 640 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  28.44 
 
 		 640 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  31.83 
 
 		 382 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  29.87 
 
 		 548 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  28.11 
 
 		 547 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  26.82 
 
 		 560 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  34.2 
 
 		 422 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  27.75 
 
 		 542 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  30.55 
 
 		 497 aa  107  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 599 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 599 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  26.27 
 
 		 644 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  29.41 
 
 		 733 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  25.31 
 
 		 626 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  26.97 
 
 		 900 aa  90.5  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  26.97 
 
 		 900 aa  90.5  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  25.7 
 
 		 665 aa  90.1  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 905 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 905 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 905 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 905 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 905 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  26.14 
 
 		 715 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  26.14 
 
 		 715 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  33.01 
 
 		 907 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  22.89 
 
 		 651 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  27.21 
 
 		 636 aa  86.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  28.15 
 
 		 902 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  27.09 
 
 		 902 aa  84.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  26.78 
 
 		 662 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  26.78 
 
 		 662 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  26.78 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  24.06 
 
 		 886 aa  80.5  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  29.52 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  26.28 
 
 		 650 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  27.31 
 
 		 754 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>