More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1129 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  50.28 
 
 
727 aa  725    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  48.55 
 
 
725 aa  707    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 
748 aa  1524    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  66.17 
 
 
734 aa  986    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  52.57 
 
 
724 aa  775    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  55.33 
 
 
727 aa  831    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  52.43 
 
 
724 aa  770    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  63.52 
 
 
1675 aa  951    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  57.02 
 
 
721 aa  860    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  55.28 
 
 
1717 aa  823    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  42.17 
 
 
715 aa  647    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  47.24 
 
 
731 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  42.56 
 
 
732 aa  616  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  44.63 
 
 
715 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  36.91 
 
 
731 aa  499  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  36.38 
 
 
721 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  37.47 
 
 
726 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  34.66 
 
 
720 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.51 
 
 
1019 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  33.06 
 
 
743 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  32.21 
 
 
906 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.33 
 
 
908 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  31.8 
 
 
906 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  33.24 
 
 
1038 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  33.06 
 
 
908 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  33.11 
 
 
1038 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.17 
 
 
1013 aa  364  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  30.91 
 
 
1042 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  32.1 
 
 
1011 aa  353  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  33.29 
 
 
1040 aa  350  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.78 
 
 
1018 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.93 
 
 
727 aa  348  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  31.2 
 
 
725 aa  340  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.81 
 
 
738 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.82 
 
 
727 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  32.18 
 
 
1018 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  28.36 
 
 
734 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.68 
 
 
1018 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  28.85 
 
 
721 aa  327  4.0000000000000003e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  28.22 
 
 
734 aa  327  6e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  30.04 
 
 
747 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  30.58 
 
 
721 aa  325  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  29.38 
 
 
737 aa  323  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  29.29 
 
 
721 aa  321  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  29.66 
 
 
726 aa  319  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  29.21 
 
 
733 aa  319  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  28.89 
 
 
716 aa  319  1e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  29.23 
 
 
699 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  29.95 
 
 
739 aa  318  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.15 
 
 
759 aa  316  8e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  28.63 
 
 
695 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  30.67 
 
 
980 aa  311  4e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25.66 
 
 
717 aa  310  5e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.85 
 
 
720 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.41 
 
 
1000 aa  306  8.000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.81 
 
 
971 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  27.65 
 
 
760 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  28.9 
 
 
712 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  29.84 
 
 
719 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  29.31 
 
 
704 aa  303  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  30.7 
 
 
731 aa  303  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  30.36 
 
 
930 aa  303  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  32.23 
 
 
975 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  29.07 
 
 
721 aa  301  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.54 
 
 
1008 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.54 
 
 
1008 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.18 
 
 
741 aa  300  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.75 
 
 
770 aa  300  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  27.5 
 
 
738 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  29.61 
 
 
739 aa  297  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  28.27 
 
 
704 aa  297  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  28.27 
 
 
704 aa  296  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  27.7 
 
 
726 aa  296  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.27 
 
 
704 aa  296  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 
753 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 
753 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  29.33 
 
 
772 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  29.23 
 
 
743 aa  295  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  29.13 
 
 
699 aa  294  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  29.28 
 
 
719 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  30.14 
 
 
720 aa  293  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  29.18 
 
 
711 aa  293  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  30.15 
 
 
745 aa  293  7e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  28.36 
 
 
722 aa  293  8e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.13 
 
 
976 aa  293  1e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  29.5 
 
 
986 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  31.68 
 
 
700 aa  290  6e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  28.92 
 
 
719 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  27.94 
 
 
726 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 
753 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.9 
 
 
753 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  28.35 
 
 
705 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 
753 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 
753 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  27.96 
 
 
968 aa  287  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  28.71 
 
 
725 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.68 
 
 
1003 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.67 
 
 
1024 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  27.87 
 
 
726 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  28.8 
 
 
696 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>