More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1061 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  100 
 
 
529 aa  1089    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  73.92 
 
 
533 aa  794    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  56.64 
 
 
533 aa  608  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  56.56 
 
 
529 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  57.03 
 
 
523 aa  603  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  56.45 
 
 
525 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  55.47 
 
 
522 aa  593  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  55.17 
 
 
527 aa  590  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  55.69 
 
 
522 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  54.95 
 
 
529 aa  582  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  54.69 
 
 
529 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  51.65 
 
 
524 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  51.47 
 
 
524 aa  545  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  41.86 
 
 
561 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  40.12 
 
 
600 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  40.24 
 
 
503 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  38.91 
 
 
504 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  39.64 
 
 
503 aa  369  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  39.44 
 
 
503 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 
504 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  38.26 
 
 
501 aa  360  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  39.64 
 
 
498 aa  359  8e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  38.93 
 
 
502 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  37.33 
 
 
498 aa  355  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  44.05 
 
 
512 aa  354  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  38.15 
 
 
504 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  37.83 
 
 
509 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  39.32 
 
 
520 aa  350  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 
502 aa  350  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  38.34 
 
 
490 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  38.03 
 
 
546 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
493 aa  341  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  38.43 
 
 
500 aa  340  4e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  39.01 
 
 
521 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  39.76 
 
 
534 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 
554 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  34.38 
 
 
523 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  32.08 
 
 
528 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  33.66 
 
 
528 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  32.64 
 
 
527 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  33.61 
 
 
546 aa  293  8e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  33.05 
 
 
527 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  33.47 
 
 
531 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  33.05 
 
 
527 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  33.78 
 
 
539 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  32.64 
 
 
553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  33.68 
 
 
547 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  33.68 
 
 
547 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  33.06 
 
 
547 aa  280  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  32.71 
 
 
547 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  32.22 
 
 
527 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 
543 aa  270  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  35.36 
 
 
542 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  38.03 
 
 
532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 
527 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 
429 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  30.39 
 
 
430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 
439 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 
428 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  30.05 
 
 
444 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  31.05 
 
 
433 aa  178  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  30.95 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 
426 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  31.83 
 
 
459 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 
472 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 
446 aa  154  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  28.65 
 
 
428 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  28.41 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 
449 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 
444 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.71 
 
 
478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 
434 aa  140  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
471 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.68 
 
 
479 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 
474 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  28.09 
 
 
434 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 
483 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
477 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 
480 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 
471 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 
471 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 
470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 
473 aa  131  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 
451 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  26.22 
 
 
490 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 
477 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 
477 aa  126  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.18 
 
 
471 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.28 
 
 
472 aa  124  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  26.15 
 
 
471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 
486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
462 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  22.6 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 
468 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 
533 aa  108  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>