25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1055 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1055  alternative oxidase  100 
 
 
228 aa  477  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000214827  hitchhiker  0.0000989196 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5300  predicted protein  60.45 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.025079 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48063  predicted protein  56.6 
 
 
314 aa  230  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_10319  predicted protein  53.2 
 
 
240 aa  224  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0970285  normal  0.563011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3824  alternative oxidase  72.92 
 
 
164 aa  219  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41170  predicted protein  49.25 
 
 
531 aa  176  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0429  plastoquinol terminal oxidase  43.61 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11341  hypothetical protein  43.61 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502236 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03651  hypothetical protein  40.82 
 
 
169 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.641535  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0341  plastoquinol terminal oxidase  41.61 
 
 
169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277464  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03641  hypothetical protein  40.14 
 
 
169 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01500  alternative oxidase 1  28.32 
 
 
401 aa  65.5  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0439  plastoquinol terminal oxidase  26.2 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0881752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3395  alternative oxidase  27.96 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.684782  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1660  Alternative oxidase  27.75 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0677  hypothetical protein  24.87 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5295  alternative oxidase  26.34 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.736306  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1576  alternative oxidase  25.95 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0387907  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4977  predicted protein  26.44 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_4970  predicted protein  26.44 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1930  putative oxidase  26.46 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.310424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00951  hypothetical protein  24.34 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02099  Alternative oxidase, mitochondrial Precursor (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P959]  27.27 
 
 
354 aa  52  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168616  normal  0.300538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2564  alternative oxidase  25.4 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.592262  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67332  Alternative oxidase, mitochondrial precursor (SHAM-sensitive terminal oxidase) (STO1)  26.19 
 
 
357 aa  45.1  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537821  normal  0.0955633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>