More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0989 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  100 
 
 
385 aa  785  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  40.05 
 
 
375 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  41.87 
 
 
376 aa  270  3e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
396 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 
354 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
386 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 
378 aa  189  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  32.07 
 
 
380 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
367 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 
352 aa  169  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
360 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
360 aa  148  1e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  28.44 
 
 
333 aa  147  4e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
366 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  25.88 
 
 
357 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  27.12 
 
 
345 aa  121  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  26.41 
 
 
363 aa  121  2e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 
382 aa  116  7e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  42.31 
 
 
247 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.28 
 
 
253 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.46 
 
 
250 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.46 
 
 
250 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.36 
 
 
250 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.72 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.59 
 
 
247 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.72 
 
 
250 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.72 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.72 
 
 
250 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.72 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.72 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.72 
 
 
250 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.69 
 
 
250 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.9 
 
 
247 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  37.21 
 
 
252 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.9 
 
 
247 aa  96.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.48695e-05  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.9 
 
 
247 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.4 
 
 
248 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  38.4 
 
 
248 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.56347e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.45333e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  4.31676e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
248 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.4 
 
 
247 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.6 
 
 
248 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.79663e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.4 
 
 
248 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.64 
 
 
248 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.6 
 
 
248 aa  94  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.64 
 
 
248 aa  93.2  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.72 
 
 
513 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  39.69 
 
 
248 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.33 
 
 
252 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 
247 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.77 
 
 
248 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 
247 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 
249 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  34.09 
 
 
246 aa  81.6  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 
281 aa  79  1e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
270 aa  77.8  3e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  34.35 
 
 
264 aa  77.8  3e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.84393e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  39.84 
 
 
271 aa  77.4  4e-13  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  37.96 
 
 
257 aa  74.7  3e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  39.84 
 
 
271 aa  74.3  3e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  36.36 
 
 
273 aa  74.3  4e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 
268 aa  73.6  6e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  32.61 
 
 
278 aa  73.2  8e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 
264 aa  71.6  2e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
275 aa  72  2e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  39.36 
 
 
244 aa  71.6  2e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  40.43 
 
 
244 aa  70.9  4e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  30.67 
 
 
282 aa  69.7  8e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  34.27 
 
 
275 aa  69.7  8e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.27 
 
 
276 aa  68.9  1e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  32.56 
 
 
254 aa  69.3  1e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  35.66 
 
 
286 aa  68.9  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  34.27 
 
 
276 aa  68.2  2e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  34.75 
 
 
501 aa  68.9  2e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  35.14 
 
 
282 aa  68.6  2e-10  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  43.42 
 
 
259 aa  68.9  2e-10  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  28.03 
 
 
275 aa  68.2  2e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.57 
 
 
276 aa  67.8  3e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
271 aa  68.2  3e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.57 
 
 
276 aa  67.8  3e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 
284 aa  67.8  3e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  33.57 
 
 
276 aa  67.8  3e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.57 
 
 
276 aa  67.8  3e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.57 
 
 
276 aa  67  6e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.57 
 
 
276 aa  66.6  8e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.43 
 
 
277 aa  65.1  2e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.87 
 
 
276 aa  65.5  2e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  28.91 
 
 
502 aa  64.7  2e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 
275 aa  65.1  2e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>