109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0982 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  100 
 
 
249 aa  512  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.01814e-10  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  73.26 
 
 
197 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  50.31 
 
 
166 aa  155  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  38.52 
 
 
178 aa  78.2  1e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.5104e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  30.12 
 
 
180 aa  77  2e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  37.04 
 
 
190 aa  77.8  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.28794e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  37.04 
 
 
190 aa  77.8  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  9.9778e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  29.89 
 
 
271 aa  73.6  3e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  32.08 
 
 
351 aa  72.4  7e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  31.82 
 
 
237 aa  69.3  5e-11  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  35.97 
 
 
258 aa  68.9  7e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.95344e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  31.47 
 
 
266 aa  68.2  1e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  35.11 
 
 
191 aa  68.2  1e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.82 
 
 
175 aa  65.5  7e-10  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.65 
 
 
175 aa  65.5  8e-10  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  32.69 
 
 
166 aa  65.5  8e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.24 
 
 
175 aa  65.1  1e-09  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 
276 aa  64.3  2e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  28.29 
 
 
238 aa  63.9  2e-09  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.44 
 
 
174 aa  63.5  3e-09  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  35.77 
 
 
175 aa  63.5  3e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  28.19 
 
 
199 aa  61.6  1e-08  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  31.41 
 
 
327 aa  61.2  2e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  29.93 
 
 
228 aa  59.3  6e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.40573e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  29.93 
 
 
228 aa  59.3  6e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  4.05887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  29.88 
 
 
273 aa  58.9  7e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  27.78 
 
 
231 aa  58.2  1e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 
171 aa  57.4  2e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  29.01 
 
 
408 aa  57.8  2e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.77 
 
 
153 aa  57.4  2e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.11247e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  28.66 
 
 
273 aa  57  3e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  29.31 
 
 
218 aa  56.2  4e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  29.49 
 
 
200 aa  56.2  5e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  33.33 
 
 
284 aa  55.1  9e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 
192 aa  55.1  1e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.7358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  26.95 
 
 
244 aa  54.7  1e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  9.67854e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  29.58 
 
 
162 aa  54.7  1e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  28.66 
 
 
255 aa  55.1  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  29.19 
 
 
266 aa  55.1  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  26.22 
 
 
155 aa  54.3  2e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  29.17 
 
 
169 aa  53.9  2e-06  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  27.16 
 
 
222 aa  54.3  2e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  28.31 
 
 
273 aa  54.3  2e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  30.19 
 
 
256 aa  53.1  4e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  32.61 
 
 
282 aa  52.4  6e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  33.33 
 
 
286 aa  52.4  7e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  28.66 
 
 
260 aa  52.4  7e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  26.71 
 
 
255 aa  52.4  7e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  26.71 
 
 
165 aa  52  8e-06  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  29.55 
 
 
382 aa  52  9e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  25.88 
 
 
166 aa  50.8  2e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  29.79 
 
 
190 aa  51.2  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  25.83 
 
 
192 aa  51.2  2e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  29.07 
 
 
227 aa  50.8  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  24.83 
 
 
161 aa  50.8  2e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  26.67 
 
 
183 aa  51.2  2e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  30.43 
 
 
346 aa  50.4  3e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  26.32 
 
 
278 aa  50.4  3e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  31.21 
 
 
324 aa  49.7  4e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 
192 aa  49.7  4e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  26.71 
 
 
255 aa  49.7  5e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  31.16 
 
 
148 aa  49.7  5e-05  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  34.82 
 
 
257 aa  49.3  6e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  27.33 
 
 
227 aa  48.9  8e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  27.38 
 
 
227 aa  48.9  8e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  27.38 
 
 
227 aa  48.5  9e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  24.24 
 
 
184 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  27.22 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  31.54 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  25 
 
 
183 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  27.59 
 
 
350 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.21604e-07  unclonable  1.45112e-05 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  30.25 
 
 
189 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  30.36 
 
 
383 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  25.43 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  23.9 
 
 
183 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  26.28 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  32.19 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  27.7 
 
 
150 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  30.94 
 
 
374 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  27.15 
 
 
247 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  31.51 
 
 
214 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  23.03 
 
 
180 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12762e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  21.29 
 
 
183 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  26.06 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  25.88 
 
 
275 aa  45.8  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  29.91 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  23.53 
 
 
187 aa  45.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  6.41477e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  25.17 
 
 
272 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  26.58 
 
 
227 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  29.23 
 
 
172 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  27.07 
 
 
214 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  22.29 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  29.79 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 
372 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  26.06 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  29.52 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  29.63 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28.05 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  27.84 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  31.79 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>