292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0976 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  45.79 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  48.83 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  48.83 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  45.92 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  48.28 
 
 		 219 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  36.82 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  33.48 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  29.7 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.01 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  32.43 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  33.8 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  31.96 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  33.51 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  29.86 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  34.6 
 
 		 251 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  33.14 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  30.45 
 
 		 299 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  35.14 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  35 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  30.66 
 
 		 256 aa  86.3  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  30.29 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  29.38 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  35.14 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  30.61 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 269 aa  85.9  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  31.98 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.5 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  34.66 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  30 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  34 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  34.84 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  26.46 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  27.71 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.44 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  27.18 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  31.98 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  38.32 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  29.36 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  32.88 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  27.14 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  31.25 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  32.11 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  33.51 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  31.25 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  29.56 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  28.64 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.72 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  39.62 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  26.36 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  32.78 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  38.68 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  29.61 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  28.5 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  25.9 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  29.88 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  35.77 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  28.89 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.09 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  33.33 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1776  competence protein F, putative  33.52 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  25.88 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  27.75 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  32.26 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2857  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0243  competence protein ComF  32.18 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  42.39 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  31.19 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  31.94 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  29.35 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2548  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.91 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  32.53 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  31.01 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  27.92 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.72 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  26.72 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>