More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0890 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
330 aa  661  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  2.01965e-07 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  85.8 
 
 
331 aa  549  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  72.39 
 
 
336 aa  452  1e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  42.11 
 
 
334 aa  230  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  45.11 
 
 
290 aa  225  9e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0407  MscS mechanosensitive ion channel  47.21 
 
 
315 aa  214  2e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.323817  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 
296 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  41.44 
 
 
324 aa  184  1e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 
304 aa  185  1e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  34.2 
 
 
328 aa  165  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  32.25 
 
 
287 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  35.64 
 
 
544 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 
349 aa  154  3e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 
276 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 
311 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 
277 aa  145  7e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  38.76 
 
 
286 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 
538 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 
550 aa  142  1e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  34.77 
 
 
298 aa  141  1e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  30.63 
 
 
531 aa  141  2e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 
551 aa  140  4e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 
445 aa  140  4e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 
551 aa  140  4e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.48 
 
 
275 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 
547 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  32.27 
 
 
534 aa  139  9e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 
304 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 
549 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 
549 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 
549 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  30.64 
 
 
297 aa  137  3e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 
302 aa  137  3e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 
275 aa  136  6e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  5.13684e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 
275 aa  136  6e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.45897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 
275 aa  136  6e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.76183e-05  hitchhiker  5.23866e-11 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 
279 aa  135  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 
533 aa  134  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 
275 aa  134  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.53066e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0743  MscS Mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 
460 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  31.32 
 
 
547 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 
275 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 
275 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  1.88457e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  32.08 
 
 
283 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 
384 aa  132  8e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  30.91 
 
 
274 aa  132  8e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 
275 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 
275 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  37.43 
 
 
305 aa  130  4e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  1.23969e-06 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 
273 aa  130  5e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  30.66 
 
 
362 aa  129  5e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5986  MscS Mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 
337 aa  129  7e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 
459 aa  129  8e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 
843 aa  129  8e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 
295 aa  129  9e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 
276 aa  129  1e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 
356 aa  128  1e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  27.92 
 
 
279 aa  127  2e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 
540 aa  127  2e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  30.11 
 
 
280 aa  126  4e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  30.26 
 
 
563 aa  126  4e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 
280 aa  126  4e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 
272 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  30.4 
 
 
275 aa  125  8e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
310 aa  125  8e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 
277 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  32.95 
 
 
275 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  30.77 
 
 
532 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 
359 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 
274 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 
275 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  29.93 
 
 
284 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.79081e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 
360 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 
274 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  26.81 
 
 
474 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  1.29425e-07 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0102  MscS mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 
537 aa  122  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.102568  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 
288 aa  122  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 
489 aa  122  1e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02489  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  33.77 
 
 
367 aa  121  1e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 
360 aa  122  1e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  27.63 
 
 
270 aa  122  1e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  34.46 
 
 
310 aa  121  1e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 
341 aa  121  2e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  26.47 
 
 
316 aa  121  2e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 
359 aa  120  2e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 
283 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  31.99 
 
 
842 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 
833 aa  120  4e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  34.38 
 
 
200 aa  120  5e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2422  MscS mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 
572 aa  119  5e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  29.89 
 
 
269 aa  119  5e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 
274 aa  119  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  31.27 
 
 
286 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  30.97 
 
 
291 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  31.56 
 
 
307 aa  119  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  31.27 
 
 
286 aa  119  8e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  31.27 
 
 
286 aa  119  8e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  31.27 
 
 
286 aa  119  8e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  31.27 
 
 
286 aa  119  8e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  31.27 
 
 
286 aa  119  8e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>