19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0845 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0845  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
376 aa  783  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355867  decreased coverage  0.00186143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2905  polysaccharide pyruvyl transferase  50.95 
 
 
367 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  1.28361e-05 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5866  polysaccharide pyruvyl transferase  49.32 
 
 
372 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2968  polysaccharide pyruvyl transferase  30.06 
 
 
343 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.41225  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3217  polysaccharide pyruvyl transferase  30.46 
 
 
334 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1722  hypothetical protein  29.65 
 
 
317 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.257484 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3112  polysaccharide pyruvyl transferase  28.94 
 
 
320 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3172  polysaccharide pyruvyl transferase  28.94 
 
 
320 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475453  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0750  polysaccharide pyruvyl transferase  26.76 
 
 
353 aa  125  8e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.759816  decreased coverage  1.35712e-05 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1915  polysaccharide pyruvyl transferase  29.41 
 
 
355 aa  118  2e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3683  polysaccharide pyruvyl transferase  24.11 
 
 
336 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6455  polysaccharide pyruvyl transferase  23.26 
 
 
361 aa  81.3  3e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.854254  normal  0.145413 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0870  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
339 aa  70.5  5e-11  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1202  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 
339 aa  67  5e-10  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.647724  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1426  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
347 aa  65.1  2e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0611  Exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.33 
 
 
321 aa  60.8  3e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48784  predicted protein  23.27 
 
 
532 aa  55.5  1e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 
342 aa  54.3  4e-06  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34576  predicted protein  22.74 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.288806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>