148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0839 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 423 aa  847    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  60.58 
 
 		 421 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  43.8 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2949  polysaccharide biosynthesis protein  33.95 
 
 		 455 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.484076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1696  polysaccharide biosynthesis protein  33.83 
 
 		 454 aa  249  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.235327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1426  polysaccharide biosynthesis protein  33.49 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  32.77 
 
 		 442 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3801  polysaccharide biosynthesis export protein-like  29.46 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3244  polysaccharide biosynthesis protein  30.12 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 487 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 507 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  26.37 
 
 		 493 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 476 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  25.34 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  26.93 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  23.82 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  23.82 
 
 		 474 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 509 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  22.87 
 
 		 501 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  24.94 
 
 		 492 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 497 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  24.69 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  24.69 
 
 		 492 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  22.89 
 
 		 501 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  24.69 
 
 		 492 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  24.69 
 
 		 492 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  24.69 
 
 		 492 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  24.16 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  24.44 
 
 		 492 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  24.69 
 
 		 492 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  25.38 
 
 		 503 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  25.38 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  25.38 
 
 		 510 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  25.38 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  25.38 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 483 aa  93.6  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 508 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  26.17 
 
 		 497 aa  90.1  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 503 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 501 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 503 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  20.72 
 
 		 475 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 467 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.16 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  21.16 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 497 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.69 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.86 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  23.51 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 490 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  19.8 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  20.61 
 
 		 502 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  20.73 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  22.01 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 500 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25.15 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 499 aa  67  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 493 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 477 aa  67  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  23.9 
 
 		 506 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>