More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0830 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  85.03 
 
 
187 aa  334  3.9999999999999995e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  72.19 
 
 
187 aa  295  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  68.82 
 
 
187 aa  284  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  68.82 
 
 
187 aa  284  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  69.52 
 
 
188 aa  278  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  71.58 
 
 
192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  67.38 
 
 
187 aa  270  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  58.56 
 
 
201 aa  227  8e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  56.91 
 
 
201 aa  221  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  54.4 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  54.7 
 
 
201 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  54.6 
 
 
202 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  54.6 
 
 
202 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  53.67 
 
 
201 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  54.24 
 
 
201 aa  203  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  54.24 
 
 
201 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  52.97 
 
 
203 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  45.96 
 
 
171 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  45.12 
 
 
171 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  43.95 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  43.95 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  47.52 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  50 
 
 
168 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  49.63 
 
 
168 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  46.9 
 
 
174 aa  137  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  49.3 
 
 
168 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  46.9 
 
 
196 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  48.89 
 
 
168 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  48.89 
 
 
168 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  51.11 
 
 
167 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  48.89 
 
 
168 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  45.07 
 
 
175 aa  134  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  43.54 
 
 
169 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  49.63 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  44.23 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  51.11 
 
 
168 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  43.97 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  48.2 
 
 
168 aa  131  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  50 
 
 
178 aa  131  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  41.67 
 
 
153 aa  130  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  42.07 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  43.17 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  39.16 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  46.26 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  44.37 
 
 
176 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  46.76 
 
 
172 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  44.14 
 
 
180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  48.89 
 
 
168 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  45.93 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  45.77 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  45.77 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  49.28 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  48.89 
 
 
168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  45.33 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  43.37 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  50.7 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  43.26 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  43.84 
 
 
187 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  40.41 
 
 
164 aa  125  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  48.51 
 
 
170 aa  125  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  39.46 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  45.39 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  48.23 
 
 
177 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  50.7 
 
 
167 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  49.28 
 
 
170 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  42.86 
 
 
173 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  48.55 
 
 
168 aa  124  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  44.23 
 
 
167 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  44.37 
 
 
185 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  42.75 
 
 
174 aa  124  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  46.67 
 
 
170 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  46.67 
 
 
170 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  41.88 
 
 
181 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  40.41 
 
 
164 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  43.15 
 
 
189 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  45.07 
 
 
185 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  43.31 
 
 
183 aa  122  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  42.44 
 
 
171 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  44.97 
 
 
181 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  44.85 
 
 
174 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  45.07 
 
 
185 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  42.6 
 
 
192 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  42.11 
 
 
182 aa  122  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  48.55 
 
 
170 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  49.3 
 
 
167 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  45.07 
 
 
185 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  40.38 
 
 
188 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  39.73 
 
 
183 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  46.48 
 
 
185 aa  122  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  40.82 
 
 
178 aa  122  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  49.3 
 
 
179 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  49.3 
 
 
179 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  47.26 
 
 
173 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  42.31 
 
 
177 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  47.1 
 
 
168 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  47.1 
 
 
168 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  47.1 
 
 
168 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  46.85 
 
 
171 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  44.37 
 
 
171 aa  121  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>