29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0812 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0812  ChaB  100 
 
 
81 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4814  ChaB family protein  65.43 
 
 
81 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.442759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3951  ChaB family protein  50.6 
 
 
82 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.385591  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0519  ChaB family protein  47.83 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1553  cation transport regulator  38.67 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.203336 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2406  cation transport regulator  35.53 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000158278 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01205  hypothetical protein  35.53 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1700  cation transport regulator  35.53 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.692804  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1923  cation transport regulator  35.53 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.41011  normal  0.0497517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01195  cation transport regulator  35.53 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1325  cation transport regulator  35.53 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2429  ChaB family protein  35.53 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1907  cation transport regulator  37.33 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1369  cation transport regulator  37.33 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.760537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1965  cation transport regulator  37.33 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.640932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1901  cation transport regulator  37.33 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.252452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1384  cation transport regulator  35.53 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.886338  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1367  cation transport regulator  35.53 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0817532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  38.46 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0295  hypothetical protein  40.79 
 
 
78 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.152807 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0020  ChaB family protein  41.79 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2331  cation transport regulator  34.67 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0461  putative cation transport regulato, ChaB  37.33 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1848  ChaB family protein  37.5 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2443  ChaB  35.53 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3607  ChaB  31.58 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0044472  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2071  ChaB  38.57 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0349  ChaB  40.32 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108518 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0930  ChaB family protein  35.44 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>