More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0691 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
211 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  87.2 
 
 
211 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  73.11 
 
 
212 aa  318  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  73.58 
 
 
212 aa  315  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  73.58 
 
 
212 aa  315  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  71.09 
 
 
212 aa  314  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  67.77 
 
 
213 aa  295  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  63.72 
 
 
227 aa  290  9e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  62.38 
 
 
218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  61.9 
 
 
218 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  61.43 
 
 
219 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  60.95 
 
 
218 aa  278  4e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  60.95 
 
 
218 aa  275  3e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  58.77 
 
 
217 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  59.52 
 
 
218 aa  268  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  58.29 
 
 
217 aa  268  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  58.57 
 
 
217 aa  268  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  57.82 
 
 
217 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  52.13 
 
 
211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 
209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  56.16 
 
 
210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  58.13 
 
 
210 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  56.65 
 
 
209 aa  231  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  56.59 
 
 
209 aa  230  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  57.21 
 
 
204 aa  228  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  54.37 
 
 
216 aa  228  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 
209 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 
211 aa  226  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 
218 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  54.97 
 
 
212 aa  224  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  54.37 
 
 
222 aa  224  9e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  55.29 
 
 
213 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  51.42 
 
 
212 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 
210 aa  222  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 
210 aa  222  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  51.44 
 
 
213 aa  222  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  52.91 
 
 
226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  51.96 
 
 
209 aa  221  8e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 
218 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  51.92 
 
 
215 aa  218  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  52.88 
 
 
216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  51.92 
 
 
217 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
216 aa  218  6e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  53.17 
 
 
219 aa  217  8.999999999999998e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  52.82 
 
 
209 aa  216  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  52.82 
 
 
209 aa  216  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 
210 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 
221 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 
217 aa  214  9e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  51.94 
 
 
219 aa  213  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 
216 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  52.66 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36377  Plastid ribosomal protein L3, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  51.9 
 
 
241 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 
223 aa  211  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  52.17 
 
 
209 aa  210  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 
219 aa  210  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  48.82 
 
 
211 aa  210  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  53.12 
 
 
209 aa  210  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 
218 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  51.74 
 
 
236 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 
217 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  50.23 
 
 
218 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 
220 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
216 aa  209  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  51.74 
 
 
219 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  49.25 
 
 
206 aa  209  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  51.22 
 
 
219 aa  209  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
210 aa  208  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
210 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
210 aa  208  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
210 aa  208  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
210 aa  208  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 
211 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
210 aa  208  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
210 aa  208  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
210 aa  208  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
210 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
210 aa  208  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
212 aa  208  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
210 aa  208  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  49.29 
 
 
211 aa  207  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  49.26 
 
 
210 aa  207  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 
210 aa  207  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 
209 aa  207  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  52.82 
 
 
210 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  50.72 
 
 
211 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 
212 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.147880000000001e-24  hitchhiker  0.0000384813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 
235 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 
209 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  51.24 
 
 
219 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  52.66 
 
 
220 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 
211 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 
211 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>