More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0621 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  100 
 
 
710 aa  1400    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  69.09 
 
 
506 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  52.05 
 
 
467 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  37.17 
 
 
500 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  50.26 
 
 
360 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  38 
 
 
567 aa  173  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  28.46 
 
 
508 aa  108  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  33.71 
 
 
515 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  21.64 
 
 
627 aa  94.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.89 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  27.64 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.07 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.07 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.98 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  28.65 
 
 
378 aa  84  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.95 
 
 
451 aa  84  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27 
 
 
479 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  22.93 
 
 
509 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  22.93 
 
 
509 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  28.4 
 
 
439 aa  83.2  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.94 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.63 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.27 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.47 
 
 
518 aa  80.9  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.94 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  26.59 
 
 
491 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  22.99 
 
 
504 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.5 
 
 
458 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25 
 
 
403 aa  80.5  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29 
 
 
442 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  33.33 
 
 
479 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  33.08 
 
 
550 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.11 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.08 
 
 
452 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.42 
 
 
390 aa  79  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  27.61 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  27.61 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.42 
 
 
480 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.78 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.8 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.26 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  28.19 
 
 
461 aa  77.4  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 
457 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  28.87 
 
 
445 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  28.86 
 
 
488 aa  77  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.47 
 
 
477 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.85 
 
 
458 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  31.72 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.56 
 
 
447 aa  75.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  25.93 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.86 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  25.41 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.2 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.12 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  30.73 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  30.54 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4511  secretion protein HlyD  27.97 
 
 
449 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.0817386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.59 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.98 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.53 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.46 
 
 
458 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.75 
 
 
433 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.75 
 
 
472 aa  73.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.11 
 
 
481 aa  73.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.6 
 
 
444 aa  73.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.56 
 
 
442 aa  73.6  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.86 
 
 
466 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.46 
 
 
458 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.72 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  33.57 
 
 
391 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.96 
 
 
430 aa  72.8  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.22 
 
 
410 aa  72  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.11 
 
 
438 aa  72  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.9 
 
 
443 aa  72  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1076  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  26.85 
 
 
274 aa  72  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.656863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.98 
 
 
460 aa  72  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.29 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.54 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.44 
 
 
468 aa  72  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.91 
 
 
480 aa  71.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.08 
 
 
480 aa  71.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.1 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  29.73 
 
 
523 aa  71.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  26.64 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  26.96 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.17 
 
 
472 aa  70.5  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.68 
 
 
456 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  28.68 
 
 
456 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  29.77 
 
 
457 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.71 
 
 
674 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.24 
 
 
514 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.64 
 
 
441 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  25.75 
 
 
627 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.23 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.68 
 
 
430 aa  69.7  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  29.03 
 
 
441 aa  69.7  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  26.27 
 
 
475 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.64 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.2 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.35 
 
 
471 aa  68.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>