More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0602 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  55.12 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  50.54 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  49.48 
 
 		 200 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  49.48 
 
 		 200 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  47.03 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  33.54 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  31.97 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.05 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 228 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30.72 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  29.22 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  28.03 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  28.57 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 424 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
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NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
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NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
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NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
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NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
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