More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0537 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0537  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
959 aa  1959    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.884465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  24.92 
 
 
1033 aa  239  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 
973 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.93 
 
 
576 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  23.49 
 
 
900 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  39.33 
 
 
250 aa  70.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  42.59 
 
 
263 aa  70.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.19 
 
 
525 aa  68.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 
567 aa  68.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.63 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  37.68 
 
 
1191 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  54.67 
 
 
255 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  38.32 
 
 
152 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  50.67 
 
 
206 aa  66.6  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  51.22 
 
 
366 aa  67  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  50.67 
 
 
206 aa  66.6  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  48.39 
 
 
256 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  45.35 
 
 
245 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1402  hypothetical protein  24.58 
 
 
1080 aa  65.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0215001 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  49.4 
 
 
366 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  40.31 
 
 
180 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  45.68 
 
 
165 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  49.4 
 
 
366 aa  65.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  49.4 
 
 
366 aa  65.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  39.09 
 
 
277 aa  65.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  44.79 
 
 
214 aa  65.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  36.3 
 
 
256 aa  65.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  46.59 
 
 
194 aa  65.1  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  41.46 
 
 
168 aa  65.1  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  48.05 
 
 
343 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  43.3 
 
 
149 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  43.3 
 
 
149 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  48.05 
 
 
343 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  42.61 
 
 
381 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 
213 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  35.04 
 
 
222 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 
175 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  36.92 
 
 
311 aa  64.3  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  40.17 
 
 
333 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 
184 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  48.19 
 
 
350 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  38.94 
 
 
381 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  44 
 
 
449 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  42.27 
 
 
386 aa  63.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  43.96 
 
 
830 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  50.67 
 
 
259 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  41.96 
 
 
216 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  44.66 
 
 
146 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 
184 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  41.75 
 
 
145 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  34.23 
 
 
167 aa  61.6  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  39.39 
 
 
189 aa  61.6  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
830 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  41.28 
 
 
294 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  42.74 
 
 
176 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  42.74 
 
 
176 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  45.56 
 
 
286 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  46.08 
 
 
340 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  42.99 
 
 
182 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  35.66 
 
 
411 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 
266 aa  60.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  45.88 
 
 
319 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  46.84 
 
 
331 aa  60.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  54.17 
 
 
264 aa  60.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  32.54 
 
 
206 aa  60.1  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  46.73 
 
 
291 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  35.48 
 
 
254 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  46.73 
 
 
291 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  38.46 
 
 
142 aa  59.7  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  39.83 
 
 
433 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  46.81 
 
 
517 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  35.48 
 
 
254 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
776 aa  60.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  49.41 
 
 
332 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  46.25 
 
 
357 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  33.59 
 
 
190 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  34.56 
 
 
145 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  39.8 
 
 
824 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  40.95 
 
 
493 aa  59.7  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  31.48 
 
 
416 aa  59.7  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  45.24 
 
 
261 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.81 
 
 
441 aa  59.3  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  45.24 
 
 
261 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  34.56 
 
 
145 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  39.67 
 
 
174 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  34.46 
 
 
204 aa  59.3  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  44.05 
 
 
292 aa  59.3  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  52.24 
 
 
130 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  32.87 
 
 
734 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 
215 aa  59.3  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  35.38 
 
 
315 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 
862 aa  59.3  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  40.79 
 
 
949 aa  59.3  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  37.9 
 
 
903 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  50.65 
 
 
391 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  32.91 
 
 
206 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0631  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
225 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
294 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  38.04 
 
 
250 aa  58.9  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  38.64 
 
 
420 aa  58.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>