157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0522 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  77.98 
 
 		 175 aa  280  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  62.96 
 
 		 169 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  61.54 
 
 		 160 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  61.54 
 
 		 160 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  49.68 
 
 		 175 aa  157  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  43.57 
 
 		 197 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  43.57 
 
 		 197 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  39.86 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  39.86 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  41.61 
 
 		 184 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  38.71 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  38.71 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  39.58 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.27 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  35.4 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  29.68 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  33.07 
 
 		 1202 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.29 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  28.33 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.09 
 
 		 407 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  33.85 
 
 		 427 aa  61.6  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  34.71 
 
 		 572 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  33.33 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  25.66 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  37.5 
 
 		 567 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  28.75 
 
 		 439 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  31.03 
 
 		 450 aa  54.3  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  30 
 
 		 463 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  32.74 
 
 		 1078 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  31.25 
 
 		 439 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  26.01 
 
 		 1361 aa  52  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  32.31 
 
 		 428 aa  51.6  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.87 
 
 		 442 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  29.75 
 
 		 629 aa  51.6  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 444 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  30.97 
 
 		 560 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.33 
 
 		 445 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 444 aa  50.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.16 
 
 		 429 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  27.54 
 
 		 453 aa  50.8  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 444 aa  50.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  29.51 
 
 		 713 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.34 
 
 		 442 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  29.17 
 
 		 1042 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.5 
 
 		 457 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.5 
 
 		 590 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  36.49 
 
 		 620 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  31.3 
 
 		 439 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1021 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 439 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  28.97 
 
 		 437 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  32.38 
 
 		 442 aa  50.1  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.59 
 
 		 430 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  30.09 
 
 		 1077 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  31.3 
 
 		 379 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15281  hypothetical protein  30.82 
 
 		 572 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.493814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  28.32 
 
 		 435 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  30.89 
 
 		 461 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.54 
 
 		 446 aa  48.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.68 
 
 		 1028 aa  47.8  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  28.68 
 
 		 438 aa  47.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  29.66 
 
 		 432 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.81 
 
 		 428 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  34.26 
 
 		 1059 aa  47.8  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  26.47 
 
 		 437 aa  47.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  29.41 
 
 		 658 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  29.71 
 
 		 432 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  27.78 
 
 		 1206 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  31.03 
 
 		 474 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.81 
 
 		 717 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  30.95 
 
 		 435 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 446 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  31.03 
 
 		 439 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.83 
 
 		 292 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  35.29 
 
 		 618 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.79 
 
 		 448 aa  45.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  36.76 
 
 		 428 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30 
 
 		 446 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  30 
 
 		 442 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  24.79 
 
 		 436 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  25 
 
 		 442 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  25 
 
 		 442 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  25 
 
 		 442 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  27.97 
 
 		 440 aa  45.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  25 
 
 		 442 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  28.68 
 
 		 469 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  27.87 
 
 		 432 aa  44.7  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  37.5 
 
 		 316 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  24.07 
 
 		 442 aa  44.3  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.07 
 
 		 497 aa  44.3  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.35 
 
 		 444 aa  44.3  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  25.22 
 
 		 441 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.29 
 
 		 446 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.29 
 
 		 446 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  29.41 
 
 		 581 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17510  hypothetical protein  27.42 
 
 		 335 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  27.87 
 
 		 403 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  27.17 
 
 		 430 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  29.35 
 
 		 451 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>