More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0508 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  250  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  93.39 
 
 		 121 aa  238  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  80 
 
 		 121 aa  206  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  78.33 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  75.21 
 
 		 121 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  69.17 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  69.17 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  56.2 
 
 		 125 aa  156  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  58.82 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 120 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  53.39 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  50.41 
 
 		 121 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  50.41 
 
 		 121 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  57.8 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  48.62 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  48.28 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.59 
 
 		 230 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  48.33 
 
 		 232 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  46.61 
 
 		 228 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 229 aa  115  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  40 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  114  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  46.15 
 
 		 230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.34 
 
 		 230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.34 
 
 		 230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  46.34 
 
 		 230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  43.7 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 223 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 234 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 216 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 239 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 232 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 229 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 229 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 236 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 233 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  43.48 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  45.3 
 
 		 231 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  45.3 
 
 		 230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  42.5 
 
 		 229 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  45.76 
 
 		 230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 240 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 227 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 235 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.7 
 
 		 229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  43.7 
 
 		 239 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 238 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  45.3 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 227 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 234 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 232 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 229 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  41.18 
 
 		 460 aa  107  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 		 240 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  38.98 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 229 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 231 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.7 
 
 		 229 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 230 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 241 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 122 aa  106  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 122 aa  106  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  38.14 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 237 aa  106  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>