194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0348 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 563 aa  1169    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  60.92 
 
 		 1014 aa  721    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.64 
 
 		 864 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 		 1252 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  37.08 
 
 		 1252 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  30.22 
 
 		 565 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 811 aa  249  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0755  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 730 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  34.46 
 
 		 784 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  29.84 
 
 		 837 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 706 aa  153  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  29.79 
 
 		 719 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  30.62 
 
 		 731 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  30.39 
 
 		 731 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 739 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 2490 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 529 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 739 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  26.56 
 
 		 745 aa  134  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 968 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 616 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1085 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 3560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 		 1007 aa  127  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.7 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 739 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  29.23 
 
 		 740 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  29.23 
 
 		 747 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 808 aa  124  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 		 1106 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 647 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.43 
 
 		 1154 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 3035 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1094 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 627 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1714 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  24.82 
 
 		 1221 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  23.84 
 
 		 715 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 700 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 738 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 789 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 633 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 727 aa  114  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  24.41 
 
 		 585 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2920  hypothetical protein  29.73 
 
 		 696 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  23.51 
 
 		 699 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1106 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.2 
 
 		 739 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  28.53 
 
 		 921 aa  109  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  24.16 
 
 		 1116 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.23 
 
 		 739 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  25.09 
 
 		 566 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 740 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  27.53 
 
 		 560 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 909 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  22.11 
 
 		 780 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 780 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16060  predicted protein  30 
 
 		 494 aa  106  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 779 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 4489 aa  106  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 750 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 		 667 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  25 
 
 		 633 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 750 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.13 
 
 		 816 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  23.2 
 
 		 1143 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 734 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 693 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 733 aa  102  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  22.04 
 
 		 553 aa  101  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 611 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 717 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.27 
 
 		 740 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 632 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.5 
 
 		 790 aa  98.2  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  21.61 
 
 		 821 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 776 aa  97.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 718 aa  97.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 776 aa  97.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  21.61 
 
 		 821 aa  97.1  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 672 aa  96.7  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  22.74 
 
 		 797 aa  97.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 713 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 717 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 633 aa  96.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  21.61 
 
 		 776 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  21.61 
 
 		 776 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  21.61 
 
 		 776 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 618 aa  96.3  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  21.35 
 
 		 732 aa  95.5  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 569 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 761 aa  94.7  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  24.22 
 
 		 630 aa  94.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  21.14 
 
 		 732 aa  94  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  21.69 
 
 		 754 aa  93.6  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  24.86 
 
 		 459 aa  93.6  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 789 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  25 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.34 
 
 		 739 aa  93.6  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>