More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0137 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  219  1e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.50493e-07  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  96.43 
 
 
112 aa  212  1e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  94.64 
 
 
112 aa  209  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  91.07 
 
 
112 aa  206  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  89.29 
 
 
112 aa  204  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 
112 aa  201  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 
112 aa  201  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 
112 aa  197  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  178  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  174  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  76.85 
 
 
112 aa  172  1e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  76.85 
 
 
112 aa  172  1e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  161  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16421  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  160  4e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1556  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.995978  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16651  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409816  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16531  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0329531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  157  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  65.18 
 
 
112 aa  156  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  155  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  155  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  154  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  154  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.16085e-05  hitchhiker  7.91345e-07 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  154  5e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  6.34529e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  5e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  154  5e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  5e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  5e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  154  5e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 
112 aa  153  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  153  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  153  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 
112 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04671  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  152  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
114 aa  151  3e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  151  3e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 
112 aa  150  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  150  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  150  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  150  6e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  150  6e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  150  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 
112 aa  150  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  149  9e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  149  9e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  149  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  3.17831e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  57.14 
 
 
112 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  148  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  148  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  148  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  60.71 
 
 
112 aa  148  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.37232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  148  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  1.99717e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 
112 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  147  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.87221e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  147  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  147  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  147  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 
112 aa  147  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  147  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 
112 aa  147  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  147  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  64.29 
 
 
112 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  147  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>