61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0126 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  89.14 
 
 
579 aa  1046    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  70.91 
 
 
602 aa  833    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  72.76 
 
 
584 aa  819    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  71.21 
 
 
605 aa  822    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  70.91 
 
 
602 aa  833    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  100 
 
 
579 aa  1168    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  70.21 
 
 
588 aa  786    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  68.91 
 
 
590 aa  802    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  54.77 
 
 
546 aa  552  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  53.63 
 
 
539 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  53.25 
 
 
545 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  47.86 
 
 
565 aa  518  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  50.17 
 
 
538 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  49.48 
 
 
538 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  49.65 
 
 
540 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  48.19 
 
 
551 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  49.03 
 
 
515 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  47.91 
 
 
509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  68.9 
 
 
509 aa  462  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  68.9 
 
 
537 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  45.78 
 
 
552 aa  445  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  65.96 
 
 
335 aa  440  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  66.87 
 
 
515 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  45.99 
 
 
496 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  61.03 
 
 
445 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  39.74 
 
 
322 aa  207  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  39.1 
 
 
318 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  35.01 
 
 
386 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  35.35 
 
 
322 aa  161  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  25.18 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  25.18 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  25 
 
 
308 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  25 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  25.34 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  23.9 
 
 
308 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  23.9 
 
 
308 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  23.9 
 
 
308 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  23.9 
 
 
308 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  23.9 
 
 
308 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  23.9 
 
 
308 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  30.77 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  23.53 
 
 
308 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  23.53 
 
 
308 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  24.09 
 
 
307 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  30.95 
 
 
306 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  23.27 
 
 
308 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  29.55 
 
 
316 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  28.39 
 
 
336 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  27.27 
 
 
350 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  27.85 
 
 
331 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  29.26 
 
 
337 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  29.94 
 
 
313 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  23.32 
 
 
313 aa  50.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  22.52 
 
 
322 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  26.9 
 
 
342 aa  48.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  28.68 
 
 
345 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  27.06 
 
 
361 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2157  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  45.61 
 
 
199 aa  45.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  28.35 
 
 
332 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  32.65 
 
 
301 aa  43.5  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0956  type II secretion system protein E  27.21 
 
 
342 aa  43.5  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.241792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>