49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0110 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0110  sodium symporter  100 
 
 
292 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1377  bile acid/sodium symporter  45.57 
 
 
277 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1482  bile acid:sodium symporter  36.74 
 
 
280 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1354  transmembrane transport protein  34.35 
 
 
278 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3238  bile acid:sodium symporter  32.34 
 
 
293 aa  129  8e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12080  predicted Na+-dependent transporter  34.35 
 
 
278 aa  127  1e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4216  Bile acid:sodium symporter  33.74 
 
 
282 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06350  predicted Na+-dependent transporter  28.12 
 
 
310 aa  84.3  2e-15  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  30.61 
 
 
298 aa  60.8  3e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  21.94 
 
 
315 aa  55.8  8e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  25 
 
 
325 aa  52.8  7e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  25.17 
 
 
310 aa  52.4  8e-06  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  27.03 
 
 
303 aa  52.4  9e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  26.78 
 
 
311 aa  52  1e-05  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  24.47 
 
 
310 aa  50.8  2e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  25.44 
 
 
303 aa  51.6  2e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  26.17 
 
 
293 aa  50.1  5e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  26.67 
 
 
297 aa  49.3  8e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  23.56 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  26.32 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  23.56 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  23.74 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  32.73 
 
 
325 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  23.29 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  23.08 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  28.18 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  27.54 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  25 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  29.81 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  24.53 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  24.68 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  29.81 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  22.73 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  23.14 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  25.35 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  27.1 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  22.27 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2757  bile acid transporter family protein  25.23 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643281  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  28.19 
 
 
336 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  23.08 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  22.27 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  27.93 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  23.9 
 
 
309 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  22.99 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  21.21 
 
 
340 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  28.03 
 
 
293 aa  42.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  24.83 
 
 
329 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  21.55 
 
 
334 aa  42.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  29 
 
 
307 aa  42.4  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>