More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0107 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  843  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  46.52 
 
 
419 aa  335  6e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  43.84 
 
 
424 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  46.02 
 
 
432 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  41.98 
 
 
446 aa  302  7e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  40.05 
 
 
447 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 
440 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  39.65 
 
 
441 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  38.69 
 
 
474 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  36.88 
 
 
431 aa  253  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 
409 aa  249  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 
408 aa  240  3e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  32.47 
 
 
413 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 
401 aa  217  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 
423 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 
421 aa  213  6e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 
413 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  34.09 
 
 
412 aa  201  2e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  33.86 
 
 
430 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  34.12 
 
 
418 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  32 
 
 
428 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.06756e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 
414 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
440 aa  189  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  30.81 
 
 
410 aa  188  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  31.95 
 
 
413 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
418 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
442 aa  186  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
412 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  31.3 
 
 
436 aa  184  2e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  32 
 
 
414 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 
421 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  31.45 
 
 
418 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  32.38 
 
 
419 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 
433 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  27.82 
 
 
403 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  32.36 
 
 
431 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  30.26 
 
 
435 aa  177  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.28 
 
 
450 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  31.75 
 
 
414 aa  174  3e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  32.73 
 
 
426 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
414 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
410 aa  170  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  32.36 
 
 
429 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
414 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
415 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  30.18 
 
 
410 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  31.2 
 
 
426 aa  167  3e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  31.43 
 
 
413 aa  167  3e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
453 aa  163  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  3.22743e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.82 
 
 
474 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
417 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  33.25 
 
 
426 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  30.63 
 
 
414 aa  159  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 
417 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
378 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
450 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  27.99 
 
 
407 aa  154  3e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
405 aa  154  3e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
435 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
404 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
418 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
461 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  30.95 
 
 
425 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 
446 aa  149  1e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 
417 aa  148  1e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
431 aa  149  1e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  30.95 
 
 
425 aa  149  1e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
403 aa  149  1e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
433 aa  147  2e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  31.88 
 
 
413 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  31.88 
 
 
413 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
424 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  31.62 
 
 
413 aa  146  8e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  29.67 
 
 
412 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
431 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.27 
 
 
446 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  29.9 
 
 
441 aa  142  1e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  30.73 
 
 
457 aa  141  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
419 aa  139  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  30.61 
 
 
405 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  29.81 
 
 
491 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  30.81 
 
 
450 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  31.93 
 
 
416 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
428 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  28.43 
 
 
418 aa  137  3e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
494 aa  137  3e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  31.56 
 
 
416 aa  137  3e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
456 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  32.53 
 
 
412 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  30.61 
 
 
441 aa  136  6e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
428 aa  135  1e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
441 aa  135  1e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
423 aa  134  2e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
442 aa  135  2e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
402 aa  133  7e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  29.17 
 
 
452 aa  132  1e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.97 
 
 
413 aa  131  2e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
432 aa  130  4e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  31.87 
 
 
424 aa  130  4e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  31.01 
 
 
429 aa  130  5e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>