More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0101 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
431 aa  897    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  64.51 
 
 
418 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  64.51 
 
 
418 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  64.92 
 
 
434 aa  569  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  63.25 
 
 
415 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  61.06 
 
 
421 aa  528  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  53.64 
 
 
443 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  49.76 
 
 
431 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  52.06 
 
 
446 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  38.52 
 
 
377 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.68 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.66 
 
 
375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  37.37 
 
 
361 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  35.98 
 
 
365 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  37.23 
 
 
358 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  36.27 
 
 
358 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 
373 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  31.2 
 
 
395 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.25 
 
 
357 aa  168  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  32.76 
 
 
389 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  33.25 
 
 
406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  31.82 
 
 
313 aa  163  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.12 
 
 
652 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.73 
 
 
313 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  31.95 
 
 
320 aa  157  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.38 
 
 
387 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  31.09 
 
 
388 aa  154  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 
671 aa  152  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 
385 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  32.39 
 
 
355 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.92 
 
 
356 aa  150  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
370 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  30.5 
 
 
689 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  31.43 
 
 
325 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 
390 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.61 
 
 
468 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 
334 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.37 
 
 
362 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
698 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.29 
 
 
405 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
686 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
308 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  28.46 
 
 
489 aa  139  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  28.17 
 
 
342 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
412 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 
500 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  31.25 
 
 
381 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 
438 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 
488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.17 
 
 
657 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  27.97 
 
 
452 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  29.84 
 
 
362 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  28.73 
 
 
450 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.27 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  30.71 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.06 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  28.12 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  28.05 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
360 aa  130  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.6 
 
 
424 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
309 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  30.34 
 
 
313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 
446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.68 
 
 
361 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 
361 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 
374 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 
406 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 
368 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  27.67 
 
 
492 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  33.83 
 
 
508 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.23 
 
 
501 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.96 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  29.52 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
662 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  34.54 
 
 
460 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  34.54 
 
 
460 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  34.97 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  35.6 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.65 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  25.57 
 
 
454 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  36.08 
 
 
283 aa  113  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.91 
 
 
312 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 
323 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.1 
 
 
468 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  27.47 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  35.29 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  23.42 
 
 
456 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
373 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.43 
 
 
404 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 
423 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  30.35 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
402 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  35.53 
 
 
414 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>