246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0098 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 384 aa  782    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  75.98 
 
 		 385 aa  612  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  63.54 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  63.25 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  59.95 
 
 		 386 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  59.95 
 
 		 386 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  59.9 
 
 		 385 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  56.54 
 
 		 399 aa  431  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  45.24 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  47.04 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  44.73 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  46.91 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  46.29 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  41.71 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  41.45 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  41.45 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  39.18 
 
 		 392 aa  322  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  45.88 
 
 		 393 aa  309  5e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  35.16 
 
 		 392 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  31.51 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  30.73 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  32.47 
 
 		 372 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  32.81 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  30.47 
 
 		 380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  31.15 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  33.76 
 
 		 376 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  32.32 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  30.99 
 
 		 378 aa  186  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  32.32 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  31.54 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  31.43 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 393 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  32.63 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  32.12 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  31.41 
 
 		 380 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  31.83 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  32.63 
 
 		 384 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  32.99 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  32.05 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  29.4 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  30.83 
 
 		 378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  30.87 
 
 		 379 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  31.7 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  29.48 
 
 		 380 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  32.3 
 
 		 380 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  28.68 
 
 		 363 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  31.32 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  30.51 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  31.32 
 
 		 385 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.04 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1104  lipid-A-disaccharide synthase  29.77 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000036555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  28.08 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  30.67 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  30.89 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  29.95 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  30.41 
 
 		 382 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 382 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 398 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  30.36 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  29.05 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  31.05 
 
 		 385 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  32.02 
 
 		 383 aa  169  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  30.36 
 
 		 375 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  31.51 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  30.79 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  30.79 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  30.08 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  29.26 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  28.64 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.48 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  28.87 
 
 		 368 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  31.45 
 
 		 411 aa  166  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  30.85 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  29.55 
 
 		 389 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  29.29 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  29.72 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  31.52 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  32.19 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  30.91 
 
 		 419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  31.01 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  31.02 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  30.65 
 
 		 372 aa  162  8.000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  31.78 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  29.9 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>