More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0094 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  100 
 
 
838 aa  1666    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  65.84 
 
 
821 aa  1053    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  57.99 
 
 
752 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  56.13 
 
 
688 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  57.83 
 
 
752 aa  685    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  49.82 
 
 
843 aa  722    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  53.86 
 
 
999 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  48.03 
 
 
721 aa  537  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  38.58 
 
 
762 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  38.18 
 
 
668 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  35.43 
 
 
743 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  34.72 
 
 
739 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  35.49 
 
 
736 aa  422  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  34.49 
 
 
712 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  35.19 
 
 
714 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  36.16 
 
 
712 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  36.66 
 
 
712 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17651  outer envelope membrane protein-like protein  32.36 
 
 
767 aa  360  6e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.773387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1450  surface antigen (D15)  39.68 
 
 
491 aa  310  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490099  normal  0.0216399 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0909  import-associated channel, putative chloroplast protein IAP75  34.56 
 
 
767 aa  211  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1555  surface antigen (D15)  39.77 
 
 
488 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00258915  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  25.38 
 
 
553 aa  194  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50834  predicted protein  28.76 
 
 
580 aa  188  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624274 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  26.46 
 
 
560 aa  172  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  25.68 
 
 
683 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  24.39 
 
 
961 aa  153  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36376  predicted protein  28.37 
 
 
519 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  28.54 
 
 
888 aa  134  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  26.18 
 
 
770 aa  127  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.91 
 
 
772 aa  125  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  25.75 
 
 
913 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  25.13 
 
 
765 aa  115  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  25.05 
 
 
752 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.86 
 
 
770 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  25.7 
 
 
893 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.58 
 
 
848 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  23.95 
 
 
790 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2265  surface antigen (D15)  26.71 
 
 
839 aa  107  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.35 
 
 
770 aa  104  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  24.45 
 
 
820 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.03 
 
 
895 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  25 
 
 
791 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.73 
 
 
769 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  25.96 
 
 
769 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  25.96 
 
 
768 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  25.96 
 
 
769 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.18 
 
 
768 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  25.96 
 
 
768 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  25.96 
 
 
768 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  25.96 
 
 
768 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  25.96 
 
 
769 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  25.96 
 
 
768 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  25.18 
 
 
768 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.18 
 
 
769 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  25 
 
 
769 aa  101  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  25.18 
 
 
769 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  25.18 
 
 
769 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.54 
 
 
784 aa  101  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.42 
 
 
892 aa  100  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.18 
 
 
750 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  24.35 
 
 
767 aa  99.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  25 
 
 
785 aa  99  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.18 
 
 
765 aa  98.2  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.43 
 
 
844 aa  97.4  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.18 
 
 
769 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.76 
 
 
802 aa  96.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.43 
 
 
854 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.58 
 
 
854 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.58 
 
 
864 aa  95.5  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  24.63 
 
 
765 aa  95.5  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.76 
 
 
808 aa  95.1  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25 
 
 
855 aa  94.4  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.91 
 
 
769 aa  94  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  25.66 
 
 
788 aa  94  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  24.01 
 
 
781 aa  92.8  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.43 
 
 
803 aa  93.2  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.19 
 
 
787 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  27.85 
 
 
777 aa  93.2  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.13 
 
 
752 aa  92.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  24.79 
 
 
765 aa  92.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.77 
 
 
784 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.91 
 
 
784 aa  91.3  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  30.26 
 
 
785 aa  90.9  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  23.05 
 
 
786 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.65 
 
 
765 aa  90.5  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  25.65 
 
 
765 aa  90.5  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  23.05 
 
 
786 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.16 
 
 
829 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  25 
 
 
765 aa  89  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.09 
 
 
793 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  27.73 
 
 
844 aa  89  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  23.13 
 
 
610 aa  88.2  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  27.27 
 
 
852 aa  87.8  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  22.95 
 
 
834 aa  87.8  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  23.51 
 
 
760 aa  87.4  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  23.09 
 
 
806 aa  87.4  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.73 
 
 
841 aa  87.4  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.88 
 
 
821 aa  87  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  25.21 
 
 
767 aa  87  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  24.04 
 
 
778 aa  87  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>