More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0083 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  32.72 
 
 
1885 aa  894  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  30.33 
 
 
1871 aa  777  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.92 
 
 
1794 aa  1392  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.99 
 
 
2017 aa  1159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.83 
 
 
1804 aa  1447  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.56 
 
 
1822 aa  836  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.96 
 
 
1805 aa  1364  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  43.11 
 
 
1908 aa  1239  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  42.73 
 
 
2051 aa  1359  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  42.17 
 
 
1914 aa  1165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  42.84 
 
 
2077 aa  1181  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45.82 
 
 
1901 aa  1611  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  46.95 
 
 
1932 aa  1327  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  47.14 
 
 
1850 aa  1637  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.38 
 
 
1797 aa  1481  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  37.19 
 
 
1774 aa  1170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.2 
 
 
1780 aa  1013  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.98 
 
 
1797 aa  785  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  30.01 
 
 
1697 aa  796  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  35.53 
 
 
1922 aa  1081  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 
1942 aa  1244  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  50.6 
 
 
670 aa  694  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 
1123 aa  840  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  42.83 
 
 
1811 aa  1422  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45.43 
 
 
1808 aa  1521  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45.25 
 
 
1795 aa  1570  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  47.34 
 
 
1805 aa  1315  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  44.18 
 
 
1934 aa  1256  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  28.87 
 
 
1739 aa  701  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  33.44 
 
 
1644 aa  853  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  35.04 
 
 
2303 aa  832  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.6 
 
 
1663 aa  835  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.74 
 
 
1668 aa  835  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  36.9 
 
 
1809 aa  947  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  35.56 
 
 
1833 aa  971  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  37.58 
 
 
1837 aa  969  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  35.12 
 
 
2272 aa  853  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  35.5 
 
 
2279 aa  878  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  30.28 
 
 
1712 aa  824  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  31.74 
 
 
1836 aa  767  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  33.25 
 
 
2109 aa  859  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  37.39 
 
 
1845 aa  951  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  100 
 
 
1780 aa  3638  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  45.36 
 
 
2361 aa  1244  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.87 
 
 
1832 aa  601  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.92 
 
 
1685 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.78 
 
 
1685 aa  596  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.15 
 
 
1885 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  27.21 
 
 
1756 aa  567  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  25.75 
 
 
1744 aa  562  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  26.12 
 
 
1710 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  27.83 
 
 
1788 aa  535  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  25.95 
 
 
1685 aa  536  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.5 
 
 
1748 aa  529  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 
1637 aa  518  1e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.07 
 
 
494 aa  511  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  26.41 
 
 
1636 aa  495  1e-138  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.16 
 
 
1682 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.02 
 
 
1682 aa  490  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 
1629 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  25.7 
 
 
1643 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  25.02 
 
 
1649 aa  448  1e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  28.31 
 
 
1112 aa  403  1e-110  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  28.45 
 
 
1064 aa  389  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  27.43 
 
 
1060 aa  368  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 
680 aa  366  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  51.26 
 
 
641 aa  363  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  1.08821e-06  hitchhiker  3.04156e-06 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  59.27 
 
 
971 aa  360  2e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  54.63 
 
 
594 aa  356  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.28 
 
 
537 aa  356  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 
1072 aa  353  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  51.78 
 
 
715 aa  350  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  53.19 
 
 
688 aa  350  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.04 
 
 
585 aa  348  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.08 
 
 
928 aa  347  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 
439 aa  345  3e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.31 
 
 
440 aa  343  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.79 
 
 
699 aa  340  1e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 
1036 aa  337  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  51.64 
 
 
920 aa  335  7e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 
468 aa  333  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  52.31 
 
 
468 aa  325  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.18 
 
 
675 aa  320  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  55.21 
 
 
468 aa  320  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  55.22 
 
 
591 aa  314  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  54.04 
 
 
551 aa  313  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  50 
 
 
437 aa  314  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  25.38 
 
 
1123 aa  312  4e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  54.04 
 
 
407 aa  308  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  50 
 
 
458 aa  306  2e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
1726 aa  303  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  46.56 
 
 
470 aa  301  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  49.82 
 
 
431 aa  292  5e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  22.72 
 
 
1473 aa  287  1e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  49.67 
 
 
390 aa  287  2e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
443 aa  286  4e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  22.64 
 
 
1473 aa  284  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  22.64 
 
 
1473 aa  284  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  46.39 
 
 
342 aa  281  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
437 aa  269  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>