71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0078 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  100 
 
 
71 aa  136  8e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  98.59 
 
 
71 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  90.14 
 
 
72 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  7.40835e-09  unclonable  2.03995e-05 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  90.62 
 
 
75 aa  115  2e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  1.12837e-08  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  86.76 
 
 
68 aa  114  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  86.76 
 
 
68 aa  114  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  80.56 
 
 
72 aa  114  4e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  82.61 
 
 
72 aa  114  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  85.29 
 
 
68 aa  113  8e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  85.29 
 
 
68 aa  113  8e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  85.29 
 
 
68 aa  113  8e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  85.29 
 
 
68 aa  113  8e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  85.29 
 
 
68 aa  113  8e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  76.06 
 
 
71 aa  110  8e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  78.26 
 
 
72 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  64.29 
 
 
98 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.53 
 
 
70 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  73.53 
 
 
70 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  74.6 
 
 
76 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  74.6 
 
 
75 aa  96.3  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.18 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.18 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.18 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  63.77 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  71.93 
 
 
74 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  60.94 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  71.93 
 
 
74 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  71.93 
 
 
74 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  63.49 
 
 
96 aa  85.5  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  59.38 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  72.73 
 
 
138 aa  83.2  1e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  66.67 
 
 
143 aa  80.1  1e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  63.64 
 
 
139 aa  79.3  2e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  65 
 
 
137 aa  79.3  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  63.64 
 
 
139 aa  79.3  2e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  63.64 
 
 
139 aa  79.3  2e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  55.74 
 
 
143 aa  75.5  2e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  70.83 
 
 
133 aa  73.6  9e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  56.92 
 
 
137 aa  71.6  3e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2323  gas vesicle protein GVPa  69.39 
 
 
54 aa  71.6  4e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  1.51045e-05  hitchhiker  0.000256299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  54.24 
 
 
121 aa  59.3  2e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2322  gas vesicle protein GVPa  55.74 
 
 
62 aa  58.5  3e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  6.61358e-05  hitchhiker  0.000258705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 
123 aa  57.4  7e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  48.28 
 
 
126 aa  55.8  2e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  50 
 
 
138 aa  51.2  5e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0685  hypothetical protein  80 
 
 
60 aa  50.4  8e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.056491  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  39.66 
 
 
126 aa  49.7  1e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 
114 aa  48.9  2e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  44.9 
 
 
178 aa  48.9  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  53.33 
 
 
104 aa  48.9  2e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  40.32 
 
 
119 aa  48.9  3e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  40.35 
 
 
152 aa  48.9  3e-05  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  48.89 
 
 
101 aa  48.5  3e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  47.83 
 
 
126 aa  48.1  4e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  47.83 
 
 
126 aa  48.1  4e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  47.83 
 
 
126 aa  48.1  4e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  51.11 
 
 
104 aa  47.8  6e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  47.92 
 
 
201 aa  47.4  7e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  43.48 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  39.62 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  43.48 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  39.22 
 
 
230 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  37.68 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  37.7 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  33.9 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  46.67 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  36.73 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  31.67 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  44.19 
 
 
148 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  37.78 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.783723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>